阿笠博士和少年偵探團(tuán)一起去看sprite的球賽，然而在最后關(guān)頭sprite卻輸?shù)袅吮荣?，于是，一行人帶著低落的心情前往百貨公司，元太因?yàn)殡y以接受事實(shí)而獨(dú)自一人留下，可在踢球的時(shí)候因摔倒而短暫暈厥過去，待他醒來撿球的時(shí)，卻發(fā)現(xiàn)了之前在停車場結(jié)識(shí)的德國人滿頭是血，讓人疑惑的是他在陷入昏迷之前一直指著元太，所幸柯南破解了他留下來的訊息并將嫌疑人鎖定在三人之中。

小說家萬田年久在旅館里趕寫小說，在編輯島木催稿離開房間后，萬田化裝成服務(wù)生，帶著貓咪諾貝爾離開了旅館。萬田路過柯南等人打簡易棒球的場地，進(jìn)入了弟子原本高平的家。萬田從代理作者原本那里得到原稿后，將其殺害了。而偶然將球打入的柯南一行進(jìn)入房間后發(fā)現(xiàn)了被殺的原本?？履蟿t發(fā)現(xiàn)了萬田的不自然。

著名畫家及川武賴四部曲作品當(dāng)中的最后一幅《青嵐》被怪盜基德盯上，柯南、小五郎也因此被請到了及川府，然而那幅畫竟然在設(shè)有監(jiān)視器的畫室里瞬間消失不見，與此同時(shí)，及川的岳父風(fēng)景畫大師神原也被發(fā)現(xiàn)死在這個(gè)房間內(nèi)，難道兇手是從不殺人的基德？之后及川在柯南的后衣口袋中發(fā)現(xiàn)了基德留下的卡片，但柯南一眼就看穿了他的把戲，并推斷出基德就在四名警察之中。

在FBI制定作戰(zhàn)計(jì)劃的同時(shí)黑暗組織就已經(jīng)展開了行動(dòng)，他們以南田陸道的名義寄給FBI一盆花，就在柯南推測敵人的意圖時(shí)，杯戶中央醫(yī)院突然涌來大波病患，這無疑也是黑暗組織的安排，在處理完花盆里埋的炸彈后，醫(yī)院陸續(xù)出現(xiàn)送貨員，而這些貨物全部都是黑暗組織送的炸彈，如果醫(yī)院爆炸，后果不堪設(shè)想，柯南和赤井秀一又會(huì)采取什么行動(dòng)？

在找到的眾多刀具中，并沒有發(fā)現(xiàn)婆婆半夜所打磨的刀，并且阿笠博士發(fā)現(xiàn)自己帶來露營用的錘子也不見了蹤跡，就在柯南思考兇手為何拿走錘子時(shí)，步美正準(zhǔn)備向魚缸里倒水，他也由此而注意到了水位的下降，斷定兇器就在魚缸中，那么兇手就一定是他！期間，柯南還發(fā)現(xiàn)了婆婆幾十年前就離家的孫子翔太，許久未見，孫子又會(huì)以什么樣的表情面對婆婆呢？