應(yīng)社樂蓮希小姐的邀請，柯南等人來到音樂世家社樂調(diào)一郎的公館，蓮希拜托小五郎調(diào)查因名琴——斯托拉地巴力毆斯所引起了一連串詭異事件，然而，就在他們談?wù)摯耸聲r，旁邊的別館火舌繚繞，在那里小憩的弦三郎也因此喪生火海，大家又重回原來的房間，柯南卻發(fā)現(xiàn)了奇怪的煙蒂，在與火樓里的煙蒂對比以后，柯南認定這并不是意外而是故意殺人，并且還將會出現(xiàn)下一個被害者。

小五郎受狩谷伴子太太所托來到狩谷家?guī)退冶慌獊G的手機，隨后大家分別對可能拿走手機的大策、嗣貴和滋英進行詢問，卻并未找到，反而在小五郎等人離開的時候，伴子找到了手機。本以為一切就此結(jié)束，誰也沒想到伴子當(dāng)晚就遭人殺害，警方對狩谷家的人一一進行偵訊，卻發(fā)現(xiàn)每個人都有不在場證明，期間，家里的仆人提起了12年前所發(fā)生的事情……

為了做天體觀測，阿笠博士帶著少年偵探隊來到一個坐落在深山里的旅館，期間結(jié)識了旅館老板天土，以及應(yīng)邀而來的野之宮悅子、二川和御上。就在大家準備上山看星星的時候，居然發(fā)現(xiàn)了一具已經(jīng)化為白骨的尸體，死者還故意留下了死亡訊息——六根煙頭，當(dāng)晚，二川的尸體被少年偵探隊發(fā)現(xiàn)，并且他的手中也握著煙頭。

柯南和服部必須在第九局下半場前解開暗號，可是時間已經(jīng)不多，這個空白暗號到底代表著什么，這時，柯南靈光一現(xiàn)想起了看臺上所缺少的17和22號門，但情況危急，必須爭分奪秒，之后服部和柯南推斷出了暗號所指的位子，沒到竟然就在小蘭她們附近，三人緊忙跑去，果然找到了第三支手機，根據(jù)手機上的數(shù)字，柯南很容易就找到了這個甲子園惡魔的位置，而他又有什么樣的苦衷？

大家找到校長詢問他下雨的時候是否出現(xiàn)在操場，沒想到卻得到了否定的回答，為了證實校長的說法，柯南又來找了在保健室休息的世古國繁，因為他與保坂從小一起長大，所以又了解了更多關(guān)于保坂的事情，這時，小蘭在走廊的木板上發(fā)現(xiàn)污漬，柯南將這些污漬與操場上出現(xiàn)的刮痕相聯(lián)系，沒錯，制造靈異事件的就是那個人!