"異常點出現在大英博物館內的展品太陽之籠內，3000年前的古生物巨鱷穿過異常點來到了倫敦街頭，肆意攻擊民眾。異常點研究中心的卡特教授帶領手下開始追蹤怪獸，并制伏了它，將它送回了該去的地方。在埃及古物學博士薩拉的啟發下，卡特漸漸意識到，他以前的想法只停留在二維空間內，以為異常點只是點到點，并沒有考慮到時間和歷史的因素。于是卡特請薩拉留下來，并要求她致力于這方面的研究。

年代久遠的山洞極易滋養邪靈，一伙士兵在已達百年歲月的山洞挖礦，被忽然出現的神秘黑影奪取性命......張顯宗護送岳綺羅返回百年洞穴，岳綺羅在兩個士兵的陪同下進入洞中，百年之前，她在洞中修成邪術布下鎖魂陣，困住許多精氣，每次遇到不測，她就回到洞中吸食精氣恢復元氣，如今，賴以生存的山洞已被無心破壞，岳綺羅看著塌陷的洞壁，無比心疼。山洞塌陷引來一團神秘黑影，岳綺羅在洞中與黑影遭遇，法力高強的她在黑影面前亦驚慌失措亂了方寸，兩個陪她進洞的士兵奔逃不及，不幸成為神秘黑影獵殺的目標。岳綺羅帶傷返回地面，在張顯宗的護送下回到文縣，張顯宗無微不至照顧她，親自治療她腿上的傷口。兩人雖是夫妻關系但無夫妻之實，岳綺羅只把張顯宗當成合作伙伴，對其無一絲愛意，張顯宗對此不以為然，義無反顧真心實意愛著岳綺羅。洞內潛伏著神秘黑影，岳綺羅決定利用黑影除掉顧玄武，只要顧玄武入洞挖金礦，定然難逃一死。張顯宗在岳綺羅的指使下對外放出準備挖金礦的假消息，顧玄武信以為真，征得大帥允許，迅速帶兵上山搶占挖礦先機。經過挖礦技工先期堪探，確認洞中埋有大量金礦，顧玄武沒有立即入洞挖金礦，而是派出一支先遣小分隊一探虛實，小分隊入洞之后遭

康納終于發現了神秘盒子的用處，原來這個神秘盒子是預測異常點位置的關鍵所在?？死锼沟倌瓤刂屏水惓｜c研究中心，企圖奪走那個神秘盒子。丹尼等人帶著盒子來到了一個安全地點暫時藏身，誰知他們卻正好碰上異常點開啟，丹尼等人與恐怖怪鳥展開了殊死斗爭，最后終于將怪鳥送回了它們自己的家。與此同時，貝克爾同萊斯特一起與克里斯蒂娜不停周旋、斗智斗勇，最終趕走了克里斯蒂娜。

地球上出現異常點集合現象，世界各地都出現了異常點。菲利普決定趁此機會利用人造異常點關閉其他異常點，并吸收其他異常點的能量。馬特和康納決定阻止菲利普這么做，他們打算關掉機器，但是菲利普對康納早有防備，結果康納和馬特沒有成功，康納還被人造異常點吸了進去。菲利普用人造異常點吸收了其他異常點的能量，并將它們關閉。

異常點開啟在醫院里，這回光顧的是二疊紀的雙齒獸，它們活潑可愛，就是愛惹些小麻煩。再加上趕上孕婦梅勒妮生產，簡直搞得卡特等人焦頭爛額。當一切處理妥善，卡特等人回到異常點研究中心時，卻發現那里已被海倫和她的復制品手下們所控制。海倫逼迫卡特說出一個不明物品的用處，卻遭到了拒絕，于是惱羞成怒的海倫命令手下引爆炸彈。幸運地被救出火海的卡特，卻重新沖回火海尋找一個重要的盒子，不想卻慘遭海倫的毒手。彌留之際，卡特將不明物品交給康納，并囑咐康納代替自己繼續異常點的研究。