當(dāng)小五郎準(zhǔn)備再度去詢問(wèn)南里薰，卻在門外聽到她的慘叫，還不等小五郎沖進(jìn)去，就從屋子里匆忙跑出了一個(gè)男子，幸運(yùn)的是南里薰并沒(méi)有被殺害，醒來(lái)之后，南里薰說(shuō)起了自己突然消失的男朋友安西，從小五郎的照片上可以看出，這個(gè)人也曾出現(xiàn)在米花飯店，這些原本不相識(shí)的人，因?yàn)檫@件古怪的命案被聯(lián)系了起來(lái)，柯南將安西、南里薰和美奈子一起找來(lái)，這兩起經(jīng)過(guò)完美設(shè)計(jì)的命案，即將真相大白！

小五郎一直暗地里跟蹤的人見松一郎，突然在米花飯店墜樓身亡，出現(xiàn)在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的還有一個(gè)叫南里熏的女人，但她卻十分肯定自己從不認(rèn)識(shí)死者。與此同時(shí)，他的雙胞胎弟弟人見竹彥，也在杯戶鎮(zhèn)的家中被人殺害，并且案發(fā)時(shí)他的妻子加奈子為了調(diào)和兄弟二人的關(guān)系，外出與松一郎會(huì)面。兄弟兩人在同一時(shí)間死在不同的地方，難道這真的是傳說(shuō)中的心靈相通？

笹本安太郎和神尾總是遭到大學(xué)時(shí)期同在推理研究會(huì)的日影的襲擊，因?yàn)閷?shí)在無(wú)法忍受這種恐懼，在笹本的提議下他們找到了小五郎，神尾說(shuō)日影曾寄給他一份小說(shuō)的原稿，而里面的內(nèi)容完全是如何殺人，而且他們的另一位同伴就死于小說(shuō)中的手法，調(diào)查期間，神尾遭到炸彈襲擊， 笹本則差點(diǎn)被車撞傷，就在警察將注意力都放在搜索日影時(shí)，柯南卻認(rèn)為兇手另有其人。

小蘭班上轉(zhuǎn)來(lái)了一個(gè)與水無(wú)很相像的男孩子本堂瑛祐，這不禁讓柯南提高了警惕，見面之后，柯南發(fā)現(xiàn)他只是一個(gè)極度迷糊的少年，也放下了心來(lái)，這時(shí)，事務(wù)所來(lái)了一個(gè)叫三角篤的男人，他委托小五郎找和自己吵架而消失的伴侶， 在柯南的提醒下，大家來(lái)到了他們初次相識(shí)的群馬滑雪場(chǎng)，沒(méi)想到他的伴侶居然在密閉的車內(nèi)死亡，雖然狀似自殺，但柯南認(rèn)為這是他殺案件，而兇手就是……

由于服部贏得了推理比賽，所以和葉不得不妥協(xié)去和柯南、小蘭等人一起去甲子園球場(chǎng)觀看全日本高中棒球賽，這里不僅因聚集了來(lái)自全國(guó)的各地的棒球精英而名聲大噪，還有四百三十顆翠綠的常春藤也讓人賞心悅目。比賽剛開始就讓全場(chǎng)的觀眾熱血沸騰，然而就在這樣熱情的氛圍之下，似乎有著什么不可知的危機(jī)正慢慢靠近……