為了陪光彥把壓歲錢存進(jìn)賬戶，柯南、步美和灰原等人一起來(lái)到帝都銀行，可元太因?yàn)槌蕴辔竿戳似饋?lái)，就在博士和灰原外出買藥期間，一波帶著面具的搶匪突然闖進(jìn)銀行，前來(lái)取錢的茱蒂老師以及一名貌似赤井秀一的人也成為了他們的人質(zhì)，雖然茱蒂用美人計(jì)在廁所獨(dú)立擊倒一名搶匪，卻不幸被同伙發(fā)現(xiàn)，事已至此，少年偵探團(tuán)成為了將徒制服的唯一希望！

連續(xù)三年都會(huì)在生日時(shí)會(huì)收到恐嚇信的?？屏瓠L子，為了今年的生日會(huì)能夠順利舉行而邀請(qǐng)毛利作為保鏢。來(lái)到保科宅邸的小五郎眾人發(fā)現(xiàn)屋子里有著眾多的時(shí)鐘，而對(duì)于時(shí)鐘的準(zhǔn)時(shí)性屋子的主任琉璍子也似乎有著非常人的執(zhí)著。在參觀屋子的時(shí)候柯南眾人還得知了屋子以前發(fā)生的事故，就在生日宴會(huì)中剛剛吹熄蠟燭的琉璍子突然被刺身亡！

為了讓扭傷腳的柯南療養(yǎng)腳傷，大伙兒一起來(lái)到城崎溫泉，然而，小蘭卻突然失蹤，柯南從光彥他們所拍的照片上看到小蘭和一個(gè)小女孩在一起，同時(shí)照片上還出現(xiàn)了一個(gè)行蹤可疑的男人。這時(shí)，柯南他們遇到了服部，他受人委托前來(lái)找一個(gè)叫陽(yáng)菜的女孩，而她正是和小蘭在一起的那個(gè)孩子。據(jù)陽(yáng)菜的父親周平所說(shuō)，在陽(yáng)菜失蹤的同時(shí)他美術(shù)館里的展品彩虹之子也不翼而飛。就在大家四處進(jìn)行尋找時(shí)，陽(yáng)菜和小蘭遇到了危險(xiǎn)。

因?yàn)榫讲⑽磸膰?guó)末身上發(fā)現(xiàn)相關(guān)門票所以也無(wú)法判斷他所觀看的比賽內(nèi)容，就在三名嫌疑人吵鬧著要回去的時(shí)候，柯南和服部說(shuō)他們已經(jīng)知道了兇手是誰(shuí)，然而卻苦于沒(méi)有證據(jù)，這時(shí)電視上體育賽事的轉(zhuǎn)播給了他們兩人提示，兇手就是他！案件結(jié)束之后，大伙一起去醫(yī)院看望蘇醒的國(guó)末，期間，警方將和葉的護(hù)身符交給了服部，得知和葉秘密的服部會(huì)有怎樣的反應(yīng)？

妖怪倉(cāng)庫(kù)是把貴重的物品放進(jìn)里面就會(huì)立刻消失的倉(cāng)庫(kù)，少年偵探團(tuán)為了弄清真相決定一探究竟，元太他們?yōu)榱俗尶履下冻鰺o(wú)話可說(shuō)的表情而干勁滿滿。在調(diào)查了倉(cāng)庫(kù)內(nèi)部之后，柯南只看到了地板上留下的零星腳印和嵌在墻上的大算盤(pán)，除此之外別無(wú)他物。但從外面的天窗向里面看的話，就能看到堆積如山的寶物，可意外的是當(dāng)再次打開(kāi)倉(cāng)庫(kù)的門時(shí)，里面的寶物就全都消失不見(jiàn)，柯南提出的天花板和地板機(jī)關(guān)的猜想被光彥等人否認(rèn)，難道妖怪倉(cāng)庫(kù)真的存在？