紀曉嵐欲將揭露云州貪案詳情的帳冊請皇上過目，不想被警惕性極高的小月發現。無奈之余，靠口技迷惑守衛，幫助皇上與一逃離了禁錮。 云州知府吳大人求見皇叔十四王爺及其愛妃四姑娘，大加挑唆利誘。此二人早有覬覦皇位之野心，此番得知皇上落難，不免蠢蠢欲動，欲借刀殺人，從而東山再起。 云州府衙被人縱火，莫愁誤以為關在府衙牢獄中的同黨黃克明遇害，大為悲痛，負氣要殺紀曉嵐報復。幸紀曉嵐有過目不忘之才能，允諾可將已被毀的帳冊毫厘不差地復寫出。恢復自由的皇上決心不惜任何代價解救出這位足智多謀的名士，雙方正欲交換人質時，黃克明卻被一支毒箭身中身亡。紀曉嵐再次倫為莫愁、小月等人的階下囚。朝夕相處中，他的橫絕于世的才華與嫉惡如仇的品格逐漸感染了兩位行俠仗義的女子。 和福康安陪同驚魂未定的皇上看戲解憂，十四王爺、四姑娘亦悄悄躲在角落，虎視眈眈，趁人不備，四姑娘回茶中投毒。

盧焯告知和珅往來于兩人之間負責傳信的家丁被殺，雖然信件沒有丟，但在家丁身上卻發現了一首詩，暗示此舉是紀曉嵐所為。正當和珅擔心自己與盧焯的暗中交易有所敗露時，卻碰巧發現為了寫書而在茶社里擺攤收故事的紀曉嵐。乾隆向和珅詢問盧焯此人，和珅以為乾隆在試探自己。和珅假意推薦紀曉嵐前往浙江調查盧焯，誰知弄巧成拙，正合了乾隆的心意。和珅以買古董為由將乾隆帶到茶社附近，示意躲在暗中的阮媽適時出現，阮媽按照和珅的吩咐向紀曉嵐講述小月的身世，那邊廂，小月也在對杏兒講述著紀曉嵐對自己的恩德及自己對紀曉嵐的情意。紀曉嵐狼狽不堪地回到家里，提議讓小月嫁人，讓謠言不攻自破，小月氣極，表示除非讓皇上做媒

和危言聳聽，恐嚇與利誘兼施，幸紀曉嵐及時趕到，將小月帶離和府。 皇上怪罪紀曉嵐尋人不利，要將他押往午門問斬，一直躲在閱微書房的莫愁被迫現身出面，紀曉嵐趁機要求金鸞殿上的皇上給莫愁名份，從此可以清清白白做人。但滿漢通婚，大清法律本不應允，要通過太后首肯，豈是易事！何況又有和等煽動一些大臣，尋隙報復，百般刁難。太后以祖宗之法罰，皇上表跪思過，患得患失之后，皇上決定讓步。 豐紳殷德一身武裝，將赴邊疆征戰。臨行之前，與軍豪剖白心跡。兩人相約，半年之內，均不談婚論嫁，建功立業后，再贏得小月芳心。 三姑自作多情，一心想與孑然一身的紀曉嵐成雙作對，害得一向無所畏懼的紀大人是心驚肉跳，避之不及。不出半年，豐紳殷德凱旋歸來，小月欣然坡門相迎，不想他已雙目失明。

和珅安排賈三等人在停尸房附近縱火．并命打手任五趁亂給尸體做手腳，以制造他殺的假象。乾隆透露貴寧告紀曉嵐有結黨之勢。和珅推薦與三院毫無瓜葛的曹文埴再次驗尸。曹文埴被假象蒙蔽，上奏乾隆死者為他殺，乾隆大怒，命令逮捕海升。眾驗尸官均感事有蹊蹺卻也無奈。紀曉嵐與曹文埴擊掌鳴誓，約定為蒙冤之人討回公道。根據海升的指點，紀曉嵐果然在書中找到關于尸體傷痕作假的記載。面對劉構的威逼，海升一身凜然，誰知劉構出爾反爾，在騙得供詞后還執意要給海升上刑。

乾隆拜祭顏驥，碰到女扮男裝的如玉。乾隆對如玉的見解產生興趣。這時殺手趕到，乾隆挺身相救，并帶如玉從樓上一躍而下逃脫了追殺。紀曉嵐想到往年和珅都請自己給太后寫祝壽賦，于是想借此來向和珅交換煙桿。誰知和珅拿出戴沾的祝壽賦來賣弄，紀曉嵐仔細看過后指出賦中暗藏對太后不敬之辭，和珅氣急敗壞。御醫為如玉療傷，卻發現如玉實為女兒身。得知紀曉嵐將賦中暗語告訴和珅，戴沾痛斥紀曉嵐。紀曉嵐苦口婆心規勸戴沾不要因一時沖動而葬送終生，兩人盡釋前嫌。乾隆下旨除去紀曉嵐《四庫全書》總纂官的職務，和珅幸災樂禍。如玉醒來得知乾隆身份大驚。乾隆佯裝不知如玉為女兒身，邀其共眠，如玉百般推辭。乾隆裝睡，如玉想到乾隆賜死全家，欲殺乾隆報仇，但想到自己為乾隆所救又不忍下手，痛苦之時想一死了之，被乾隆攔下。乾隆心下斷定如玉與顏驥有關。和珅指使同為編纂官的馮大人到獄中探望戴沾，馮慌稱要把戴沾的手稿編纂成冊，卻暗中將手稿交給了和珅，以換取自己落在和珅手中的罪證。乾隆帶如玉前往四庫館。如玉盡顯才學，被乾隆指派到四庫館修書。