小蘭、園子和世良三人在上學(xué)途中發(fā)現(xiàn)了路旁的遺體，遺體的旁邊留下了用血寫下的“死”字，這就和十年前工藤優(yōu)作唯一沒(méi)有揭穿犯人的事件幾乎一樣，為了調(diào)查這兩期案件的共同點(diǎn)，他們打電話給高木警官，但參與十年前案件的目暮警官看過(guò)遺體后卻以竊盜事件定性，回憶著十年前的一幕幕柯南依舊沒(méi)有明白自己父親的用意。

受百合香小姐之邀小五郎帶著小蘭和柯南前往了葡萄園，在那里他們看到了前來(lái)簽合同的山口先生，而百合香小姐的丈夫健吾卻帶著契約不知所蹤。水町帶來(lái)的契約上已經(jīng)有了健吾的簽名，在水町帶著小五郎等人參觀葡萄園時(shí)百合香小姐依舊沒(méi)能找到自己的丈夫，他們一起前往酒庫(kù)后才發(fā)現(xiàn)健吾已經(jīng)遇害，而除了水町之外其他的人都有不在場(chǎng)的證明。

高木警官完全沒(méi)有向任何人告知行蹤便獨(dú)自出了遠(yuǎn)門，在警視廳門前等待高木警官的少年偵探團(tuán)們遲遲等不來(lái)人，這時(shí)一個(gè)男人交給了他們一個(gè)說(shuō)是高木警官送來(lái)的包裹。佐藤警官打開(kāi)包裹后發(fā)現(xiàn)里面放著一個(gè)平板電腦，按下電源后看到的竟然是身處于危險(xiǎn)之中的高木警官，即便高木警官還保持著冷靜，但體力透支的他還能撐多久？

社長(zhǎng)夫人就好像是在簽名的時(shí)候被默默溜進(jìn)來(lái)的幽靈毒害了一樣，就像是寄給服部奇怪信件的人類擅自虛構(gòu)出來(lái)的不正常的存在所下的毒手。門把和拖鞋上所撒的毒粉只是掩人耳目的手段，而饑餓的玉郎也是因?yàn)橘Z斯特羅錯(cuò)覺(jué)選擇了有毒的蛋糕，和高木警官的對(duì)話后柯南和服部已經(jīng)知道了兇手的辦案手法，但他們現(xiàn)在依然缺少?zèng)Q定性的證據(jù)。

在死去的西澤家里發(fā)現(xiàn)了作案的手法和遺書，看似自殺的現(xiàn)場(chǎng)還存在很多疑點(diǎn)，在現(xiàn)金還沒(méi)有歸還的情況下小五郎檢查繼續(xù)調(diào)查。西澤的好友田中和公司社長(zhǎng)的互相指正引起了小五郎的懷疑，而一路探查的柯南看到了漂浮在宇田川河面上的部分鈔票，經(jīng)過(guò)整理之后柯南得知了這次事件的兇手，而他將代替感冒的小五郎為大家揭曉真相。