聽到都禮所說的秦廣大王的罪行后，石敢當決定親自去質問秦廣大王身為神仙，為何要危害百姓。石敢當化成都禮的樣子去一間廟中找秦廣大王，一進來秦廣大王便問他是否拿到了祭品，沒想到秦廣大王竟然真的指使屬下去做迫害百姓之事，石敢當現出原形要打他，秦廣大王趕緊攔住石敢當，并將自己不得不這樣做的緣由告訴他。冥界被妖魔占領，神仙們都被奎剛擄走，只有他逃出了冥界來到人間。奎剛把冥界里的厲鬼都放了出來禍害人間，沒了地府供給的營養，厲鬼們甚至闖入百姓家中吃人，秦廣大王表示自己費了很大的力氣才把厲鬼們聚集在一起，從地府被逼來陽界的他沒辦法只好想出讓都禮去找血食祭品給厲鬼們供給營養的方法。結合秦廣大王的話，石敢當突然想起來黑蓮圣使曽說過玉帝駕崩，天庭由奎剛掌管的話。石敢當意識到天界可能真由奎剛霸占了，他所看到的一派祥和的天庭應該是奎剛制作出來的幻境。晚上石敢當身上的金丹顯了光，太上老君就在金丹里，他告誡石敢當相信自己所看到的。石敢當與朱半斤來到雙塔縣城，他們進入城中，卻發現城里一個人都沒有。二人進入雙塔寺，寺中全是和尚們的尸體，突然畫面一轉他們來到了天庭，師父楊戩問他們為何不繼續尋找凡間奎剛的法身，反而回到了天庭

朱半斤在仙草園里面見到里面有許多好吃的瓜果，于是偷吃了起來，沒想到被看院子的仙童給抓了起來，帶到了碧霞元君面前。碧霞元君誤會他和毒蜂怪是一伙的，于是命人把朱半斤痛打一頓，轟出了山門。朱半斤下山以后見到自己妹妹，被妹妹又數落了一頓。幾個人正在說話，忽然有一群毒蜂從身旁往碧霞祠那邊飛了過去，所過之處草木枯萎，看上去非常厲害。原來這伙毒蜂的頭子是一個妖怪喚作毒蜂怪，這次過來是來找碧霞元君要三葉草的。九圣仙童和毒蜂怪打了起來，九圣仙童不敵，碧霞元君出現救下了徒弟。原來毒蜂怪是蜃的徒弟，蜃派出毒蜂怪要隱身草，到時候就可以讓奎剛隱身進入三界。聽到這里，碧霞元君自然是不肯給的，但是毒蜂怪生命力頑強，碧霞元君根本打不死他。此時石敢當出現，用火焰燒跑了毒蜂怪，毒蜂怪不敵而逃。碧霞元君這才知道石敢當并不是和毒蜂怪一伙的，向石敢當道歉，說先前誤會了對方。眾人進入道觀說話，九圣仙童還送了果子給朱半斤吃。石敢當告訴了碧霞元君自己為什么要來索要隱身草，是為了除去為非作歹的孽龍。聽到這里，碧霞元君同意了將隱身草送給對方，為百姓除害。石敢當擔心毒蜂怪繼續為非作歹，于是主動提出幫助碧霞元君除去毒蜂怪。幾個人來到了伏牛山

玉帝封敖申為黃河龍神，敖申情緒激動地哭了出來。封禪典禮結束后，石敢當、朱半斤、敖申與楊戩、哪吒聚在一起聊天，哪吒的師父與楊戩是好友，因此他一直稱楊戩為師叔，而石敢當是楊戩的徒弟，哪吒便讓石敢當不要見外，與他兄弟相稱即可。聊天時敖申卻一直緊鎖眉頭不言不語，石敢當問他有何煩心事。敖申告訴石敢當，玉帝封他為黃河龍神，不禁讓他想起姑父黃河龍伯，以前黃河由他的姑父掌管，可他的姑父卻被武德星君誣陷，最后含冤而死。石敢當向敖申詢問黃河龍伯被冤死的具體原因，敖申告訴他們，自己是北海龍王敖閏的兒子，但因為是庶子，所以從他出生起，敖閏就討厭他。有一天敖申與手下在外散步，遇到了騎馬奔馳的武德星君的兒子武吉，囂張跋扈的武吉諷刺敖申不過是個庶子，在北海沒有任何地位，氣急的敖申出手傷了武吉。晚上武德星君便闖入北海龍宮向敖閏告狀說敖申將他的兒子打成重傷，并要求懲罰敖申，敖閏叫來敖申當面訓斥了他一頓，并讓武德星君親自責罰敖申，要殺要剮都隨便。本來與父王關系就不好的敖申當場與敖閏斷絕父子關系并跑去黃河投奔姑父，黃河龍伯得知此事后幫敖申在黃河申請了一個天職，武德星君要抓敖申必須要經過雷聲普化天尊的同意才可以。雷聲普化天尊

石敢當等人到了五莊觀后，發現觀里的人都被殺害，石敢當利用天地寶鑒看到假王母帶走鎮元子的全過程，他們啟程去瑤池救鎮元子，臨走前朱半斤與哪吒勸石敢當拿走天地寶鑒，以備不時之需。王母娘娘實為黑鴉大王，他逼迫已喝下百轉丹的鎮元子說出金丹的下落，鎮元子不肯說，這時鎮元子因為服下百轉丹而暈倒在地。黑袍護法也來到瑤池，二人要將鎮元子帶走時，四海龍王卻突然率兵將瑤池團團圍住，黑袍護法與黑鴉大王被打入海中的船里。他們在船里商量如何才能讓鎮元子說出金丹的下落，黑鴉大王提議既然鎮元子表示此事只能對石敢當說，只要他化成石敢當的樣子便能引鎮元子上鉤。 黑鴉大王化成石敢當來詢問鎮元子金丹一事，鎮元子坦白之前太上老君曾囑托他，三界有難時，將金丹的下落告知石敢當，鎮元子將所有金丹的準確位置都告訴了他。得到金丹位置后，面前的石敢當化成黑鴉大王的樣子，黑袍護法本想將鎮元子殺害，黑鴉大王攔住他并認為鎮元子依舊有利用價值，要帶上一起走。二人帶著兩名侍衛來到斗牛宮拿金丹，取得金丹后黑鴉大王提議去蒙界繼續尋找金丹，而且從兜率宮的乾坤地理圖中去蒙界是最快的方法。為了盡快得到金丹，黑袍護法只好讓手下關閉兜率宮中所有機關，黑鴉大王留下

黑袍護法帶著手下突襲楊戩，原本以楊戩的實力對付黑袍護法等人綽綽有余，但由于奎剛趕到灌口加入戰爭，楊戩被奎剛鉗住并帶走。為避免楊戩將天庭浩劫之事告訴石敢當，奎剛決定先用計打敗石敢當。奎剛把手下的妖魔們送到阿修羅小作坊整容并去除身上的妖氣，畢竟三界不能被妖魔長期看管，奎剛將這些克隆神仙投入到各個道場，從此整個世界都由他掌控。石敢當在泰山當值，他坐在椅子上打盹時夢到玉帝與眾神被火燒，旁邊還有一個黑衣人要求石敢當做他的護法。石敢當被夢驚醒，這時二郎神楊戩來到此處，楊戩告訴他天庭有難，玉帝請求他回去支援并催促他快些走以免誤了大事。石敢當突然注意到今日楊戩手中握的劍并非平日里不離身的至尊巨劍，而是一把普通的劍，兩人在回天庭的路上石敢當不停地試探楊戩的口風，最終假楊戩被他識破。假楊戩實為黑蓮圣使所扮，黑蓮圣使勸石敢當歸服于奎剛，以后好處自然少不了，石敢當當然不肯，隨后兩人進入戰斗狀態，黑蓮圣使利用寶物烏金黑蓮制住石敢當。這時石敢當突然被朱半斤的聲音驚醒，石敢當以為自己只是做個噩夢，可他一抬頭卻看到烏金黑蓮依舊在他頭頂。石敢當利用朱半斤的好奇心從烏金黑蓮里逃了出來，黑蓮圣使不僅被打跑還丟了寶物烏金黑蓮