京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內(nèi)外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀(jì)曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻(xiàn)書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀(jì)曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認(rèn)為一切都因紀(jì)曉嵐而起，決定替父報仇，紀(jì)曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

紀(jì)曉嵐義正詞嚴(yán)，歷數(shù)“監(jiān)糧”案中上下官吏貪污、無恥的惡行，皇上萬分震驚。但鑒于牽扯人員太多，法不責(zé)眾，只將主犯王旦望正法，以震懾那些貪心亡命之徒。 貪官污吏被繩之以法，百姓歡呼雀躍，紀(jì)曉嵐不敢放松警惕，居安思危，某日，負(fù)責(zé)登記王旦望被抄沒家產(chǎn)的文書王斬柱，向紀(jì)曉嵐透露，王家贓物中不少貴重珍品已被私吞。 莫愁、小月閑來無事，拿和消遣，硬要他陪同逛街，三人信步來到一古玩店，竟有意外收獲，先后購得一枚蘇卿憐曾戴的頭飾和名畫《清明上河圖》。和明知這都是被官府沒收的贓物，命人告密，大內(nèi)侍衛(wèi)領(lǐng)兵查封了古玩店和當(dāng)鋪，和又借機敲詐“監(jiān)糧”案主審江南道御史陳輝祖。 從莫愁、小月的閑聊中，紀(jì)曉嵐得知贓物出處，陷入對這個“案中案”的沉思當(dāng)中。 陳輝祖早就準(zhǔn)備了一厚一薄兩本帳冊，應(yīng)付府衙存檔，并決定將罪過推倒因害怕報復(fù)正逃之夭夭的王斬柱身上。

小月、莫愁趁夜色正濃，救洪御史出逃，但因翻找藏在石料間的帳本，耽擱了時間，未及上路，即被尚榮等圍追堵截。洪霞以御扇相威脅，無奈尚榮橫下心來，必置之死地而后快。 尚榮親審洪御史，曲陽縣令仗義執(zhí)言，通融不成。尚榮判洪家父女與小月三人斬立決。千鈞一發(fā)之際，皇上一行匆匆趕到，一見此景，直隸總督尚榮頓時全身發(fā)軟，癲倒在地。 三百里流放之路走下來，里里長見識，里里有故事，并抓獲了修建望春園時貪污經(jīng)費的元兇，真是不虛此行。但為了小小地教訓(xùn)一下沒少難為自己的紀(jì)曉嵐和總是又瞞又洪的和，找回心理平衡，皇上有意找碴把二人又關(guān)進大牢。 在紀(jì)曉嵐眼里，和是一個以邀諂媚為己任的小人，而和則說紀(jì)曉嵐聰明反被聰明誤，無端招惹是非。皇上離不開兩位讓人讓人愁的臣子，竟來到獄中與二人做起了文字游戲。

小月望著一片廢墟、傷心之極。從小春口中得知紀(jì)曉嵐等已從暗道逃走，小月破涕為笑。乾隆向百官念叨缺少銀兩以備軍需，紀(jì)曉嵐帶領(lǐng)著工匠出現(xiàn)，許諾可以幫乾隆解決難題。人證、物證俱在，齊蘇圖只得低頭認(rèn)罪。銀妃以死要挾乾隆放過齊家。見乾隆不為所動，銀妃自盡。和珅為了擴大自己在朝中的勢力，暗中支持村夫李二組織邪教，從而謠言惑眾，籠絡(luò)人心。一時之間，朝廷內(nèi)外盡是李二的信徒。工部因大做法事導(dǎo)致衙門失火。和珅答應(yīng)撥款給工部金尚書以重修工部衙門。御史海升之妻組氏參加了當(dāng)日作法，海升將失火原因告知了紀(jì)曉嵐。和珅同黨吳省蘭將作法用書《佛法心經(jīng)》奉與皇上，并夸口只要通讀此書，便可百病不侵。和珅不失時機地推薦吳省蘭任左都御史。乾隆以紀(jì)曉嵐著成《四庫全書》為由，指派他上任左都御史，并對其寄予厚望。紀(jì)曉嵐上任之時，和珅的黨羽劉構(gòu)傲慢無禮地當(dāng)眾打坐，向紀(jì)曉嵐挑釁。紀(jì)曉嵐覺察出邪教實力強大，決定剝繭抽絲，調(diào)查到底。

紀(jì)曉嵐堅持讓乾隆追查以抓出幕后主謀，乾隆認(rèn)為紀(jì)曉嵐沒有真憑實據(jù)難以信服。趙青斥責(zé)乾隆昏庸，乾隆在和珅的挑唆下欲治她的罪，紀(jì)曉嵐甘愿替趙青接受懲罰。小月與趙青相互傾訴對紀(jì)曉嵐的情意，兩人盡釋前嫌，成為好姐妹。和珅傳旨紀(jì)曉嵐被革職。紀(jì)曉嵐頗感失意，詢問趙青是否愿意與自己歸隱山野。趙青以江山社稷為重，拒絕了紀(jì)曉嵐。兩人借酒澆愁，四目相對，不能自己。紀(jì)曉嵐酒醒之后發(fā)現(xiàn)趙青已不辭而別，不禁為自己一時沖動而懊悔不已。紀(jì)曉嵐帶乾隆來到香積庵，根據(jù)了凡寫在墻上的暗語，找到了被藏在佛像之下的財寶。