去趕海的柯南和小哀，阿笠博士和少年偵探團(tuán)的各位，在那兒結(jié)識(shí)了悶悶不樂(lè)的大學(xué)生牛込嗣夫。后來(lái)，牛込迂的社團(tuán)成員三瀨隆、八島光枝、久津梢子買(mǎi)東西回來(lái)。路上4人的神情十分奇怪、一吃完午飯便回去了。之后，柯南留意到牛込忘了拿耙子，當(dāng)元太等人吧耙子送去給牛込趕到停車(chē)場(chǎng)時(shí)時(shí)卻發(fā)現(xiàn)了牛込已經(jīng)死在車(chē)內(nèi)！

放學(xué)后，小蘭在鞋柜里發(fā)現(xiàn)了一封情書(shū)，正當(dāng)她為此而煩惱時(shí)，遇到了曾在帝丹高中上學(xué)的學(xué)姐，她說(shuō)家里遭到了不明人士的入侵，可奇怪的是小偷不僅沒(méi)偷錢(qián)，反而還給她死去的丈夫上了一炷香，并且自己的日記也有被人查看過(guò)的跡象，期間學(xué)姐還談起了高中時(shí)期被自己拒絕過(guò)的男生，看過(guò)照片后，小蘭說(shuō)她今天見(jiàn)過(guò)這個(gè)男生，之后，園子將整個(gè)事件的來(lái)龍去脈推理出來(lái)，這時(shí)，學(xué)姐說(shuō)她還有一件事瞞著大家……

小五郎和柯南去拜訪人氣作家梅津修時(shí)，撞見(jiàn)了他的兒子與他發(fā)生爭(zhēng)吵的畫(huà)面，為了避嫌他們就暫時(shí)離開(kāi)，可是到了傍晚，梅津修卻被人毒死家中，他的手中還拿著一個(gè)顛倒的笏，就在他們解謎死亡訊息時(shí)，目暮警官和兩個(gè)關(guān)系人也匆忙趕來(lái)，警方還在死者兒子是的身上搜到了毒藥，本以為一切就此結(jié)束，柯南卻發(fā)現(xiàn)了新的線索，他將小五郎麻醉，說(shuō)出了事情的真相。

牛迂的死因是喝了摻進(jìn)氰化鉀的綠茶后中毒身亡。神奈川縣的橫溝警官發(fā)現(xiàn)裝著氰化鉀的瓶子翻倒在尸體下。然而牛迂打開(kāi)了綠茶的瓶蓋后沒(méi)人再碰過(guò)，因而他斷定這是自殺案件。但柯南卻對(duì)此很懷疑。之后柯南發(fā)覺(jué)元太的舉止很古怪，于是調(diào)查三瀨等人的車(chē)內(nèi)垃圾，找到了決定牛迂絕他殺的證據(jù)。犯人也最終承認(rèn)了自己的罪行。

笹本安太郎和神尾總是遭到大學(xué)時(shí)期同在推理研究會(huì)的日影的襲擊，因?yàn)閷?shí)在無(wú)法忍受這種恐懼，在笹本的提議下他們找到了小五郎，神尾說(shuō)日影曾寄給他一份小說(shuō)的原稿，而里面的內(nèi)容完全是如何殺人，而且他們的另一位同伴就死于小說(shuō)中的手法，調(diào)查期間，神尾遭到炸彈襲擊， 笹本則差點(diǎn)被車(chē)撞傷，就在警察將注意力都放在搜索日影時(shí)，柯南卻認(rèn)為兇手另有其人。