7年前杯戶街上發(fā)生了一起搶劫殺人案，案件當(dāng)時(shí)只有一個(gè)目擊證人，那就是5歲的小女孩友里未央奈。7年后小五郎帶著蘭和柯南一起來(lái)到鳩笛莊度假，友里未央奈正是鳩笛莊女主人的女兒。來(lái)度假的客人井出正也無(wú)意間談起了7年前很熱門的特?cái)z劇彗星假面超人比恩，這讓友里未央奈陷入了恐慌之中，因?yàn)楫?dāng)年那起搶劫殺人案的犯人戴的就是假面超人比恩的面具。

警方確定了一起寶石搶劫案的嫌疑人，嫌疑人鷹取嚴(yán)男躲在一個(gè)倉(cāng)庫(kù)里，不知為何柯南與小五郎也在場(chǎng)。警方突破倉(cāng)庫(kù)門進(jìn)入準(zhǔn)備抓捕嫌疑人時(shí)，鷹取嚴(yán)男打開事先設(shè)下的陷阱，趁現(xiàn)場(chǎng)混亂之時(shí)綁架了柯南當(dāng)做人質(zhì)逃跑。柯南在犯人車上伺機(jī)逃跑，不料卻跑進(jìn)死胡同里被抓。無(wú)奈之下柯南被帶到了一個(gè)荒廢的倉(cāng)庫(kù)里，犯人鷹取嚴(yán)男究竟想讓柯南做些什么？

唐三忍著被電的劇痛，用藍(lán)銀草把鐵籠子的欄桿死死捆住，他拼盡全力往外拉，藍(lán)銀草一點(diǎn)點(diǎn)被電枯萎，唐三被電到口鼻出血，鐵籠子的欄桿才拉開一個(gè)大縫，唐三因?yàn)轶w力透支暈倒在地，小舞和玉小剛急忙從大縫里出來(lái)攙起唐三。唐三掙扎著爬起來(lái)，他試圖召喚藍(lán)銀草，結(jié)果無(wú)動(dòng)于衷，玉小剛勸他不要再浪費(fèi)力氣了，他的武魂已經(jīng)徹底廢掉了，蕭塵宇對(duì)唐三冷嘲熱諷，逼他俯首稱臣，玉小剛使出雙魂環(huán)，蕭塵宇根本不屑一顧，還取笑玉小剛是廢人，玉小剛讓唐三和小舞屏住呼吸，他召喚出沉睡的唐三炮，唐三炮跳起腳來(lái)沖蕭塵宇他們放了一個(gè)大煙彈，把蕭塵宇和柳龍等人當(dāng)場(chǎng)熏暈，蕭塵宇揚(yáng)言要追到圣魂村殺了他們，玉小剛惱羞成怒，返回來(lái)暴打他一頓，蕭塵宇嚇得連連求饒。玉小剛斷定蕭塵宇不會(huì)善罷甘休，唐三想回圣魂村把父親一起接走。王圣不肯放過(guò)這難得的報(bào)仇機(jī)會(huì)，把蕭塵宇一刀斃命。凌風(fēng)聞?dòng)嵹s來(lái)，看到蕭塵宇被割喉而死，就把昏迷的柳龍叫起來(lái)問(wèn)明緣由，凌風(fēng)看到被掰彎的鐵籠子，得知此事是玉小剛，唐三和小舞所為，讓柳龍把在場(chǎng)的侍衛(wèi)都叫起來(lái)，一起去圣魂村追殺唐三他們，否則城主會(huì)讓所有人陪葬。唐三帶著小舞和玉小剛回到圣魂村，可唐昊不在家，玉小剛發(fā)現(xiàn)家具上落了厚厚的灰，猜到家里

小蘭的母親妃英理在自己的事務(wù)所突然被人綁架，但她趁綁匪不注意躲進(jìn)了廢棄的大樓內(nèi)，并用搶來(lái)的手機(jī)向小蘭求救，雖然遭到了綁匪的干擾但柯南還是分辨出來(lái)了妃英理所發(fā)的信息內(nèi)容，從中獲得了一些線索后柯南帶領(lǐng)小蘭和小五郎立刻展開救援，但被綁架的地點(diǎn)可能有兩處，柯南能在危急時(shí)刻找到正確的位置嗎？

柯南所在的班里來(lái)了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫線，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉(cāng)庫(kù)里可能有石灰，元太和光彥開玩笑說(shuō)舊倉(cāng)庫(kù)有幽靈出沒，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉(cāng)庫(kù)。在尋找石灰的過(guò)程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門，眾人合力打開門后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……