警方分別對三位女當(dāng)事人進(jìn)行了詢問，并檢查了她們隨身攜帶的物品，而案發(fā)現(xiàn)場所發(fā)現(xiàn)的白色涼鞋成為了本案最大的疑點(diǎn)。在諸多線索的指引下，柯南和世良很快便推理出兇手的身份，但卻未能明白兇手的作案手段。最終在園子不經(jīng)意的提示下，柯南順利地將案發(fā)過程演繹給眾人，成功找出真兇。而兇手與死者之間，竟有這樣一段不為人知的往事……

毛利小五郎受久須美工械廠社長的委托，調(diào)查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對職員們暗中調(diào)查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對象，三人計(jì)劃在倉庫抓住罪犯的現(xiàn)行，不料卻發(fā)現(xiàn)谷崎死在了反鎖的房間里。正當(dāng)案件一籌莫展時(shí)，谷崎生前研究的老鼠機(jī)器人引起了柯南的注意。

柯南所在的班里來了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫線，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉庫里可能有石灰，元太和光彥開玩笑說舊倉庫有幽靈出沒，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉庫。在尋找石灰的過程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門，眾人合力打開門后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……

少年偵探團(tuán)的理科自由研究作業(yè)是拍攝鎮(zhèn)子的全景照片，為此阿笠博士帶他們來到云丸山露營，在山中小屋他們遇到了正在爭吵的四人，而三年前意外去世的元木是他們爭吵的焦點(diǎn)。爭吵過后岳美負(fù)氣離開睡在了懸崖底下，半夜的時(shí)候榮子等人為三年前因意外去世的元木默哀，正好醒來的柯南見證了這一幕，但在第二天元太卻發(fā)現(xiàn)山下的岳美小姐倒在了血泊中。

米小圈要去扔垃圾，忽然看到門口還有一個(gè)大箱子，還以為是自己家的垃圾，他很快將這個(gè)箱子一起推到電梯口，箱子是鄰居的，開門拿東西卻看到紙箱被人推到電梯口，因?yàn)榧敝匚萁与娫挘掖颐γΤ鰜砜吹较渥佑直蝗私o推到電梯口了。米小圈也很奇怪，明明把紙箱帶到電梯口兩次，卻轉(zhuǎn)眼莫名又回來了，終于將對面鄰居抓個(gè)現(xiàn)行，鄰居摘下眼鏡告訴米小圈，他是個(gè)作家，擔(dān)心米小圈不相信還把自己出的書給他看。對照了書上的照片之后，米小圈對作家非常膜拜，原來名人就住在自己隔壁。不久，米小圈的作文被登到雜志上，同學(xué)們羨慕得不行，米小圈卻自嘲這有什么，他將來是要當(dāng)作家的，同學(xué)們紛紛嘲笑他吹牛，讓米小圈出版一本書給他們看看。米小圈從來沒有寫書的經(jīng)驗(yàn)，寫一本書至少要好幾萬字，爸媽也沒有寫作的經(jīng)驗(yàn)給米小圈出的主意都沒有可行性，米小圈忽然想到隔壁還有個(gè)大作家可以用，立刻登門拜訪。已經(jīng)過了飯點(diǎn)，大作家還沒有吃飯，看到米小圈要磕頭拜師，大作家立刻擺擺手，讓他不要搞這些形式主義，說著打了一個(gè)餓嗝，看到師父餓了，米小圈立刻跑回家找方便面火腿腸，媽媽看到米小圈要送拜師禮，立刻將家里僅剩的牛肉罐頭拿給米小圈。作家吃了牛肉罐頭，開始認(rèn)真給米小圈教導(dǎo)如何