小五郎一直暗地里跟蹤的人見(jiàn)松一郎，突然在米花飯店墜樓身亡，出現(xiàn)在案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的還有一個(gè)叫南里熏的女人，但她卻十分肯定自己從不認(rèn)識(shí)死者。與此同時(shí)，他的雙胞胎弟弟人見(jiàn)竹彥，也在杯戶鎮(zhèn)的家中被人殺害，并且案發(fā)時(shí)他的妻子加奈子為了調(diào)和兄弟二人的關(guān)系，外出與松一郎會(huì)面。兄弟兩人在同一時(shí)間死在不同的地方，難道這真的是傳說(shuō)中的心靈相通？

柯南和光彥等人在放學(xué)的路上遇到了警察辦案，詢問(wèn)得知，一個(gè)叫江上的婆婆被自己家陽(yáng)臺(tái)的花盆意外砸死，鄰居們都把江上稱為“烏鴉婆婆”，她曾偶然在垃圾堆里翻出中獎(jiǎng)券，于是便常常去翻垃圾窺探鄰居的隱私，而招致大家的反感，就在警方想以意外事件結(jié)案時(shí)，柯南察覺(jué)到從樓頂?shù)粝聛?lái)的花盆很奇怪，經(jīng)過(guò)調(diào)查，他認(rèn)定這是一起蓄意殺人事件。

小五郎受狩谷伴子太太所托來(lái)到狩谷家?guī)退冶慌獊G的手機(jī)，隨后大家分別對(duì)可能拿走手機(jī)的大策、嗣貴和滋英進(jìn)行詢問(wèn)，卻并未找到，反而在小五郎等人離開(kāi)的時(shí)候，伴子找到了手機(jī)。本以為一切就此結(jié)束，誰(shuí)也沒(méi)想到伴子當(dāng)晚就遭人殺害，警方對(duì)狩谷家的人一一進(jìn)行偵訊，卻發(fā)現(xiàn)每個(gè)人都有不在場(chǎng)證明，期間，家里的仆人提起了12年前所發(fā)生的事情……

大家找到校長(zhǎng)詢問(wèn)他下雨的時(shí)候是否出現(xiàn)在操場(chǎng)，沒(méi)想到卻得到了否定的回答，為了證實(shí)校長(zhǎng)的說(shuō)法，柯南又來(lái)找了在保健室休息的世古國(guó)繁，因?yàn)樗c保坂從小一起長(zhǎng)大，所以又了解了更多關(guān)于保坂的事情，這時(shí)，小蘭在走廊的木板上發(fā)現(xiàn)污漬，柯南將這些污漬與操場(chǎng)上出現(xiàn)的刮痕相聯(lián)系，沒(méi)錯(cuò)，制造靈異事件的就是那個(gè)人!

為了謹(jǐn)慎起見(jiàn)，佐藤拜托目暮警官分別派人監(jiān)視這三個(gè)可疑人士，就在大家擔(dān)心浩太，而不知如何是好時(shí)，浩太居然從外面回來(lái)了，看著平安無(wú)事的浩太，大伙兒懸著心終于放下了，可是人質(zhì)雖然回來(lái)，還是不知道犯人是誰(shuí)，佐藤主張一查到底，可將史卻不愿再追究下去，這時(shí)，高木警官注意到了腳底濕漉漉的浩太，詢問(wèn)之后，他便一人沖了出去……