警方聽過答錄機(jī)里的留言后，分別向留言的蓬田、檜垣和稻葉打電話確認(rèn)，發(fā)現(xiàn)每個(gè)人都有不在場(chǎng)證明，雖然警察沒有頭緒，但柯南卻早已知道兇手是誰，可介于小林老師的暗中觀察，柯南不能表現(xiàn)的太過明顯，于是，他將自己的推理簡(jiǎn)單告訴元太他們，讓他們分擔(dān)必要的說辭，提醒警察逐一排除其他兩名嫌疑人犯案的可能，那么，最有可能犯案的就是他！

阿笠博士和小蘭帶少年偵探隊(duì)去露營(yíng)的時(shí)候，正巧碰到了一對(duì)因帳篷而發(fā)生口角的情侶，他們離開之后，柯南等人占領(lǐng)了他們?cè)葴?zhǔn)備搭建帳篷的樹蔭，不料這時(shí)，正在帳篷里熟睡的小蘭被不明人士綁走，之后，警方在一個(gè)懸崖下發(fā)現(xiàn)了歹徒的車子，根據(jù)歹徒遺留下來的手機(jī)，小蘭很有可能在15點(diǎn)之前被人殺害，到底是誰綁架了小蘭？柯南他們能否在15點(diǎn)之前找到小蘭呢？

沒過一會(huì)兒，柯南就收到了園子被人搶走的手機(jī)傳來的簡(jiǎn)訊，雖然還不知道傳簡(jiǎn)訊人的意圖，但柯南卻察覺到事有蹊蹺，他立刻打電話給小蘭讓她注意安全。與此同時(shí)，他還解開了博士留下的暗號(hào)，根據(jù)這個(gè)暗號(hào)的設(shè)計(jì)原理，他突然想起了死者見山所留下來數(shù)字的含義，然而，此刻遠(yuǎn)離柯南的園子和小蘭就在兇手的車子上……

柯南、步美等人從博士家里找到了一封四十年前來自博士初戀情人的信，信上除了說每十年在回憶的地點(diǎn)見面之外，還留下了一串像是暗示地點(diǎn)的數(shù)字，而今天剛好是四十年后的相約之日。經(jīng)過推理，他們一行人來到動(dòng)物園，將信上的數(shù)字與動(dòng)物入園的順序相結(jié)合，他們找到了飛鼠館，而正巧在他們的面前站著一位女性，她會(huì)是阿笠博士的初戀嗎？

為了謹(jǐn)慎起見，佐藤拜托目暮警官分別派人監(jiān)視這三個(gè)可疑人士，就在大家擔(dān)心浩太，而不知如何是好時(shí)，浩太居然從外面回來了，看著平安無事的浩太，大伙兒懸著心終于放下了，可是人質(zhì)雖然回來，還是不知道犯人是誰，佐藤主張一查到底，可將史卻不愿再追究下去，這時(shí)，高木警官注意到了腳底濕漉漉的浩太，詢問之后，他便一人沖了出去……