這天柯南陪同小蘭和園子來(lái)練瑜伽減肥，這時(shí)他們碰到來(lái)參加減肥班的出川，而出川厚子故意的刁難的態(tài)度迫使教練里月跪下息事寧人。而在晚上的訓(xùn)練厚子也早退走掉，獨(dú)自回到屋里。訓(xùn)練之后保子因?yàn)榍貌婚_(kāi)出川的門(mén)而來(lái)找里月，但開(kāi)門(mén)之后出現(xiàn)的確實(shí)中毒身亡的出川！在勘察現(xiàn)場(chǎng)之后肯納發(fā)現(xiàn)了犯人的犯罪手法，犯人也承認(rèn)了因?yàn)閳?bào)仇而殺人的事實(shí)。

柯南、小蘭和小五郎在百貨公司吃飯的時(shí)候，結(jié)識(shí)了樂(lè)隊(duì)吉他手中村悠介，之后，小蘭和他一起去地下室拿取CD，沒(méi)想到竟然在休息室看到了主唱渡邊友紀(jì)子的尸體，警方立刻展開(kāi)調(diào)查并且對(duì)樂(lè)隊(duì)其他人進(jìn)行偵訊，每個(gè)人都有殺人的動(dòng)機(jī)和嫌疑，就在他們互相指責(zé)懷疑之時(shí)，柯南在八樓發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵性的線索，兇手果然就是那個(gè)人！

連續(xù)三年都會(huì)在生日時(shí)會(huì)收到恐嚇信的保科琉璍子，為了今年的生日會(huì)能夠順利舉行而邀請(qǐng)毛利作為保鏢。來(lái)到保科宅邸的小五郎眾人發(fā)現(xiàn)屋子里有著眾多的時(shí)鐘，而對(duì)于時(shí)鐘的準(zhǔn)時(shí)性屋子的主任琉璍子也似乎有著非常人的執(zhí)著。在參觀屋子的時(shí)候柯南眾人還得知了屋子以前發(fā)生的事故，就在生日宴會(huì)中剛剛吹熄蠟燭的琉璍子突然被刺身亡！

警方在將這三個(gè)嫌疑人分開(kāi)偵訊之后，又在死者的包里發(fā)現(xiàn)了一把手槍和強(qiáng)盜集團(tuán)百鬼夜行留下的字條，并從小島權(quán)作的秘書(shū)那里得知，他舉辦此次活動(dòng)是為了尋找殺死自己愛(ài)犬的同叫小島的強(qiáng)盜頭目，于是柯南利用與死者相同的方法找出兇手，雖然證據(jù)被銷(xiāo)毀，但他巧施妙計(jì)讓兇手自己主動(dòng)承認(rèn)了罪行。

解決了暗號(hào)事件回到日本的柯南終于恢復(fù)了正常的生活，在放學(xué)回家的路上元太提議大家進(jìn)入即將拆遷的大樓內(nèi)來(lái)玩捉迷藏。就在這時(shí)元太發(fā)現(xiàn)有奇怪的敲打墻壁的聲音，柯南發(fā)現(xiàn)這是有人發(fā)出的求救聲音，就在他們?cè)谒褜さ倪^(guò)程中發(fā)現(xiàn)了在檢查大樓的兩個(gè)工人。兩人告訴柯南他們那是他們發(fā)出的響聲不用在意但在柯南的推理下少年偵探團(tuán)們開(kāi)始尋找被困的人，就在這時(shí)之前的檢查工人卻抓住了小哀，究竟應(yīng)該這應(yīng)該辦！