小五郎一大早便被少年偵探團纏上，他們委托小五郎調(diào)查的案件是米花町活動中心的花圃破壞事件，而在調(diào)查過程中與山崎小姐發(fā)生爭執(zhí)的花店老板奧田態(tài)度非常惡劣，因為小咲小姐的緣故小五郎決定介入調(diào)查。當(dāng)眾人晚上再次來到活動中心時花圃已經(jīng)遭到了破壞，在破壞的花圃旁還看見了山崎小姐的尸體，奧田被當(dāng)場抓住，但事件的真相到底是什么呢？

為了查出監(jiān)禁高木警官的地點，警方持續(xù)搜查的時候三位關(guān)系者漸漸浮上臺面，鎖定了可能是嫌疑犯的人后警方馬上進行潛入，雖然向嫌疑人澄清了事件的真相，但早已服毒的嫌犯在沒有說出監(jiān)禁地點的情況下死亡。另一方面，好不容易掙脫了雙腳束縛的高木警官丟下了腳邊的布后卻發(fā)現(xiàn)了綁在木板下的定時炸彈。

正在和立野巡警交談的柯南等人看到了精神恍惚的貴和子小姐，前去詢問時才得知她要拜訪的大岡先生死在了家中，今天前來拜訪的貴和子小姐和久榮先生都是被大岡勒索的人，用勒索得來的錢財用來du博的大岡讓兩人非常痛恨，但他們卻說自己并沒有殺死大剛先生，案發(fā)現(xiàn)場醒目的縮寫字母K，這個令人疑惑的死前訊息成了破案的關(guān)鍵。

洋房的主人傳了封群組訊息集合所有的兄弟姐妹，此時大家看到了浮現(xiàn)在窗邊驚悚模樣的主人，一起目擊了飛翔在天空中的怪物，隨后他們還發(fā)現(xiàn)了次男的尸體，案件愈發(fā)的破朔迷離。這起靈異的命案和之前洋房主人未婚妻的事故有著千絲萬縷的關(guān)系，而策劃那起事故的正是兄弟姐妹中的某人。

為了完成寫生作業(yè)的少年偵探團來到了米花市的郊外，在那里他們看到了草叢上的UFO，而這與一起殺人事件有著關(guān)聯(lián)。正當(dāng)柯南等人詢問高木警官時UFO的主人小沼博士出現(xiàn)了，在調(diào)查研究所時發(fā)現(xiàn)了死者和自己要好的大哥萬年先生都為大藏工作，小沼先生正好買了大藏的字畫，而身藏巨款的大藏臨死之前告訴死者和萬年的訊息便是UFO。