少年偵探團對于賈斯丁的事件還是非常在意，偷偷溜出來的他們和柯南一起展開了調查，聰明的賈斯丁并沒有坐以待斃，顯眼的他四處留下關于自己的信息，而柯南根據這些信息終于找到了他。犯人終于被捕，但事件卻還沒有結束，熊紋公司的社員井上先生有著太多的疑點，柯南能感覺到這件事情還不止這么簡單。

在警方介入調查奈奈美母親的墜亡事件時，少年偵探團的孩子們卻不見了蹤影，而現代當家的助手長瀨先生也不見了?？履系热嗽谏衩氐陌岛谥杏龅搅烁魇礁鳂拥臋C關，在塔內他們還遭到了神秘人物的追趕，當柯南反應過來時身邊的伙伴們都消失不見，獨自尋找同伴的他想起了奈奈美的哥哥所說的話語，暗黑之塔寶藏的秘密即將揭曉。

小五郎在酒吧里（前篇）

裝滿水果的寶箱（前篇）

因為小蘭不在家，柯南和小五郎決定去杯戶町的一家拉面館吃飯，雖然這家飯館標榜的是美味的要死的拉面，但店面卻相當破舊，隨后，想要在這條商業街炒地皮的奸商西津也來到這里并與老板小倉、店員彩代以及隔壁理發店長谷中發生了激烈爭吵，使這里的氣氛變得一團糟，唯一值得安慰的是端出的拉面果真是絕頂美味，然而，西津卻在吃完拉面后倒地身亡，是意外還是謀殺？