在銀行的出租保險(xiǎn)箱里面，躺著銀行員工園田真知子的屍體，而且外面的鐵門還拉下，在外面還貼了一張報(bào)警就會(huì)引爆炸彈的紙。新一先將屍體跟室內(nèi)的狀況拍攝下來，并且要小五郎確認(rèn)倒在里面的女子是不是真知子。小五郎表示突然接到真知子的電話，請(qǐng)他到銀行來說有事情跟他商量，可是當(dāng)他到銀行時(shí)，真知子就已經(jīng)倒在里面...

小蘭的同學(xué)直子被綁架，當(dāng)歹徒發(fā)現(xiàn)有警察時(shí)，便放棄交易開車沖進(jìn)海里，直子再次下落不明，直子父親的秘書花井很是擔(dān)心。某日，小五郎突然接到不要在調(diào)查此事的要求，柯南察覺事有蹊蹺，暗暗潛入直子家后聽到了花井和直子爸爸的談話，原來直子的爸爸再次接到歹徒電話，但他卻不愿花五億保女兒的性命，這讓花井很生氣，柯南躲在后備箱里，跟著他們來到交易場(chǎng)所，見到了所謂的「歹徒」。

少年偵探團(tuán)在海灘度假的時(shí)候，偶然認(rèn)識(shí)了春日財(cái)團(tuán)的大少爺和他的女朋友小忍。元太玩球時(shí)撿到了小忍發(fā)出的SOS求救漂流瓶，順著漂流瓶的方向，他們?cè)谝粋€(gè)洞窟找到小忍，原來這都是春日的安排，眼看海水滿潮，無法原路返回，大家在柯南的指揮下順利從洞穴另一邊逃出，看到小忍還活著，春日露出丑惡嘴臉以步美為人質(zhì)，關(guān)鍵時(shí)候小蘭趕來，將春日制服。

步美某日經(jīng)過傳說中的鬼屋，而且還看到屋內(nèi)有鬼火！為了一探究竟柯南，步美，光彥還有元太一起出動(dòng)來到這個(gè)傳說中的鬼屋。因?yàn)槲葜鞅粴⒑蠹依锏钠渌司屯蝗婚g不知去向，于是許多鬧鬼的傳說就此傳開。但在柯南和少年偵探團(tuán)的各位探查之后發(fā)現(xiàn)了鬼屋中真的有人居住著！在調(diào)查了屋子之后柯南終于發(fā)現(xiàn)背后真正的秘密。最終殺害房子主人的兇手也自首承認(rèn)罪行。

園子和小蘭被邀請(qǐng)去皆川家參加情人節(jié)派對(duì)，柯南悄悄尾隨卻被發(fā)現(xiàn)。皆川的母親熱情招待各位，但皆川卻是一副不耐煩的樣子，他拒絕了青梅竹馬關(guān)谷香的巧克力，又對(duì)直道和若松冷嘲熱諷，狀態(tài)不佳的他決定外出透氣，他的心儀對(duì)象好美也一起跟去，突然一聲尖叫，皆川倒在了草坪上，到底是誰在情人節(jié)制造了慘劇？