毛利小五郎帶柯南和小蘭來(lái)高級(jí)餐廳用餐，進(jìn)門(mén)后三人發(fā)現(xiàn)桌上擺滿(mǎn)了食物卻沒(méi)有客人，并在廚房發(fā)現(xiàn)了倒在地上的廚師口石先生。清醒后的口石先生告訴三人，原本有五名客人在餐廳里用餐，不料自己在做飯時(shí)遭到了歹徒的襲擊，客人們也不知去向。毛利小五郎馬上通知了目暮警官，并查清了每個(gè)客人的身份，然而卻難以判斷消失的客人們?nèi)チ撕翁帯Ｕ谶@時(shí)，擺放在餐桌上的甜點(diǎn)和雜物引起了柯南的注意。

為了追蹤倉(cāng)田屋駒吉的下落，柯南等人來(lái)到荻市進(jìn)行調(diào)查，卻不慎遭到了神秘人的槍擊，所幸無(wú)人受傷。因擔(dān)心明日香的安危，毛利小五郎迅速向明日香致電，正當(dāng)二人通話(huà)時(shí)，明日香卻遭到了神秘人的綁架。寶田先生告訴眾人犯人疑似是藤木律師，并猜測(cè)明日香被綁架的地點(diǎn)在指月公園。而柯南則在明日香掉落的手機(jī)中發(fā)現(xiàn)了其他線(xiàn)索，只身一人前往目的地搜尋明日香的下落。

夜晚園子心血來(lái)潮帶著小蘭和柯南來(lái)公園里觀賞銀河，不料卻在花壇里發(fā)現(xiàn)了一起行兇案。園子透過(guò)望遠(yuǎn)鏡看到了一雙女子的手，她手上的戒指正在被兇手摘下，園子過(guò)于震驚沒(méi)有看到兇手的長(zhǎng)相。之后園子大概確定了行兇案的方向，帶著小蘭和柯南組成女高中生偵探團(tuán)去破解這樁行兇案。

小五郎讓柯南和小蘭陪他一起去位于大分的別府溫泉旅行，說(shuō)到別府溫泉最有名的莫過(guò)于地獄巡游之旅，就在小蘭和柯南興致勃勃討論的時(shí)候小五郎卻在一旁默不作聲。在柯南和小蘭的逼問(wèn)下小五郎才說(shuō)出了實(shí)情，這次的旅行目的是尋找仲代電氣社長(zhǎng)的女兒麻奈美，柯南根據(jù)照片找到了麻奈美所住的旅館，但這僅僅只是開(kāi)始。

走在櫻花盛開(kāi)的小道上小蘭不由得想起了與新一的初次相遇，那還是在上幼稚園的時(shí)候。急忙趕去上班的小五郎不小心踩壞了小蘭的櫻花名牌，英理只能先給女兒用紙做了一塊名牌應(yīng)急，但小蘭卻因?yàn)檫@塊名牌受到其他小朋友的譏諷，同樣是櫻花班的新一稱(chēng)自己也丟了名牌，他要求小蘭也為自己做一個(gè)。