京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來(lái)勢(shì)突然朝廷內(nèi)外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱(chēng)知道香氣由來(lái)，原來(lái)紀(jì)曉嵐為了撰寫(xiě)《四庫(kù)全書(shū)》而廣征天下藏書(shū)，好友顏驥踴躍獻(xiàn)書(shū)。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動(dòng)下，將顏驥全家賜死。紀(jì)曉嵐無(wú)力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點(diǎn)燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨(dú)特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認(rèn)為一切都因紀(jì)曉嵐而起，決定替父報(bào)仇，紀(jì)曉嵐扮作戲子，在戲臺(tái)之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

小月、莫愁趁夜色正濃，救洪御史出逃，但因翻找藏在石料間的帳本，耽擱了時(shí)間，未及上路，即被尚榮等圍追堵截。洪霞以御扇相威脅，無(wú)奈尚榮橫下心來(lái)，必置之死地而后快。 尚榮親審洪御史，曲陽(yáng)縣令仗義執(zhí)言，通融不成。尚榮判洪家父女與小月三人斬立決。千鈞一發(fā)之際，皇上一行匆匆趕到，一見(jiàn)此景，直隸總督尚榮頓時(shí)全身發(fā)軟，癲倒在地。 三百里流放之路走下來(lái)，里里長(zhǎng)見(jiàn)識(shí)，里里有故事，并抓獲了修建望春園時(shí)貪污經(jīng)費(fèi)的元兇，真是不虛此行。但為了小小地教訓(xùn)一下沒(méi)少難為自己的紀(jì)曉嵐和總是又瞞又洪的和，找回心理平衡，皇上有意找碴把二人又關(guān)進(jìn)大牢。 在紀(jì)曉嵐眼里，和是一個(gè)以邀諂媚為己任的小人，而和則說(shuō)紀(jì)曉嵐聰明反被聰明誤，無(wú)端招惹是非。皇上離不開(kāi)兩位讓人讓人愁的臣子，竟來(lái)到獄中與二人做起了文字游戲。

軍豪不愿見(jiàn)到朝中大亂，黎民涂炭的悲劇出現(xiàn)，冒死諫阻。忠言逆耳、皇上大怒。莫愁以家國(guó)為名，表示愿放棄兒女之情，并險(xiǎn)些喝下墮胎之藥。幸虧紀(jì)曉嵐以三寸不爛之舌，說(shuō)服她靜待時(shí)日，總有一天可以破鏡重圓。皇上寧為玉碎，不愿瓦全，斷然拒絕墮胎入宮的提議，要帶莫愁奔走天涯。和與紀(jì)曉嵐難得默契合作，強(qiáng)行挽留住了他的腳步。 中秋佳節(jié)，皓月當(dāng)空，卷帙浩樊的《四庫(kù)全書(shū)》編纂工作大功告成，皇上應(yīng)邀來(lái)閱微草堂，與兩情相悅的莫愁團(tuán)圓依偎在一起。和、太后先后亦登臨紀(jì)府，異口同聲要求皇上回宮。正鬧得人仰馬翻之際，莫愁突然動(dòng)產(chǎn)，生死攸關(guān)，太后以過(guò)來(lái)人的經(jīng)驗(yàn)竟擔(dān)當(dāng)起接生婆的工作。 小皇子呱呱落地，眾從如釋重負(fù)。等著嗷嗷待哺的孩子，太后身上的母性復(fù)蘇，破天荒地承認(rèn)了這是皇家血脈，一樁延宕多日，屢經(jīng)曲折的姻緣終于名正言順，成為事實(shí)。 皇恩浩蕩，軍豪恢復(fù)狀元名號(hào)與小月重修百年之好，豐紳殷德亦接受賜婚，與十八格格結(jié)為夫妻。勞苦功高的紀(jì)曉嵐，則被賜賞了一桿金煙袋，作為“尚方寶劍”。從此，天下的貪官污吏任紀(jì)曉嵐敲打，天下的不平之事由紀(jì)曉嵐主持公道……"

了凡記錄下來(lái)的涉及徇私舞弊的人員名單顯示敏德正是首貪。看到確鑿證據(jù)，乾隆下令抓捕敏德。收到和珅的消息，敏德連夜逃走。紀(jì)曉嵐建議乾隆從嚴(yán)查處涉案人員以警示世人，并重新閱卷以示公正。趙新進(jìn)看到自己榜上有名，欣喜不已。敏德借和珅之名要見(jiàn)紀(jì)曉嵐，紀(jì)曉嵐不知有詐，被敏德襲擊。關(guān)鍵時(shí)刻，趙青救了紀(jì)曉嵐一命，自己卻受傷。乾隆下令斬首敏德，并決定重開(kāi)恩科。和珅依然擔(dān)任主考官。紀(jì)曉嵐帶小月去專(zhuān)賣(mài)應(yīng)考用具的“連升店”，看到無(wú)奇不有的作弊工具，還有一間名為“獨(dú)占鰲頭”的書(shū)院。

除了災(zāi)民們?cè)孤曒d道，偶遇的縣府差役也在講述官吏們的貓膩。皇上勃然大怒，差點(diǎn)忘了自己微服私訪的身份。 百姓祈雨，傾窠出動(dòng)，紀(jì)曉嵐說(shuō)服皇上當(dāng)眾宣諭，免去受災(zāi)地區(qū)交納皇糧的賦役。皇上悟知一路所見(jiàn)乃紀(jì)曉嵐刻意安排，自己不過(guò)充當(dāng)了一回道具，但念其為民請(qǐng)命的正義，也就轉(zhuǎn)怒為喜，不以為忤了。 和車(chē)隊(duì)從旁經(jīng)過(guò)，小月見(jiàn)地上遺有一枚青色蓮花頭飾，知是蘇姑娘之物。只是奇怪，她何以坐在和府的車(chē)隊(duì)當(dāng)中。 和煞費(fèi)苦心，創(chuàng)造種種優(yōu)惠條件照顧蘇姑娘，以取悅為之動(dòng)情的風(fēng)流天子。紀(jì)曉嵐以和新鑿石獅違反禮制為由，向心懷鬼胎的皇上發(fā)難，皇上無(wú)言以對(duì)，只有擺出天子架子，罰他打磨石獅。 皇上欲金屋藏嬌，即被紀(jì)曉嵐拐戀抹角敲打了一番，甚是不快。小月以卿憐珠花為敲門(mén)磚，向和求見(jiàn)蘇姑娘，二人一見(jiàn)如故，情同姐妹。