小五郎受委托調(diào)查游戲軟件工程師板倉死亡。目暮警官斷定是心臟病發(fā)作的殺人事件。小五郎懷疑三名委托人是嫌疑犯，但沒有證據(jù)。柯南為了得到記錄著黑色組織線索的被害者日記磁片，急于解決事件。但一直沒有機(jī)會。而在案件調(diào)查方面最終在看到不自然的圍棋盤之后柯南得知死者留下的死前訊息并指出了兇手的所在。

古裝劇小說家月形龍?zhí)傻牡茏泳蜜嘈垡唤g死的尸體在公園被發(fā)現(xiàn)。以前接受過月形的取材采訪的毛利小五郎懷疑跟久坂爭奪弟子之位的猿橋勝。但是很快猿橋的不在場證明就得以證實(shí)。在柯南拼命思考的時(shí)候，月形的著作上“逆轉(zhuǎn)接著逆轉(zhuǎn)”的文字跳入眼簾。這時(shí)終于注意到不在場證明的柯南將有關(guān)者聚集起來解明真相。

幸運(yùn)的是兩人都沒有受傷，演出也能順利進(jìn)行。然而，就在大家驚訝于華麗的舞臺和逼真的場景時(shí)，煙霧繚繞劇場內(nèi)卻發(fā)生了命案，死者是話劇的男主角，案發(fā)時(shí)，新一立刻跑到舞臺上并在那里發(fā)現(xiàn)了手槍和空彈殼，之后又想起了出現(xiàn)在舞臺上的紅色瞄準(zhǔn)線，但他卻不認(rèn)為兇手是從觀眾席殺人，反而肯定兇手當(dāng)時(shí)就在舞臺上，而嫌疑最大的就是和男主角糾纏不清的四名女演員。

平次，葉子終于安全到達(dá)小五郎的事務(wù)所，五人在吃飯的時(shí)候說道最近都內(nèi)發(fā)生了連續(xù)發(fā)火事件，現(xiàn)場總會留下紅色的馬的人偶。次日，柯南等人造訪委托他們的諸角宅邸后亮子也以可能是自己多疑了為由放棄了委托。而在柯南他們監(jiān)視的過程中遇到了風(fēng)水師曾我和亮子的沖突。就在柯南眾人回去之后又再次發(fā)生了火災(zāi)而地點(diǎn)正是亮子的住處。

藤枝干雄被殺，雖然家中每個(gè)人的反應(yīng)有著微妙的差別，但卻都有不在場證據(jù)。在警方的調(diào)查之后，在妃英理和有希子的推理下判定為內(nèi)部作案。而在有希子詢問了園丁土肥之后眾人又發(fā)現(xiàn)了新的疑點(diǎn)。在父親工藤優(yōu)作的暗示基礎(chǔ)上，柯南了解了兇手作案的手法，而最終有希子在柯南的幫助下揭開了事件的謎底。