小五郎和警察立刻對與死者有關的人士展開偵訊，雖然三個嫌疑犯都很有犯案的動機，可是卻苦于找不到證據而且殺人手法也難以破解，當晚，柯南發現了小五郎早早就準備好放在枕頭底下的禮物，并且還從他的夢話得到了啟示。為了給小五郎在這個特殊的日子提供表現的機會，柯南暗中提醒，所幸小五郎一點就通知道了兇及其犯案的手法。案件結束后，小五郎深情款款拿出禮物，可是這個迷糊的偵探卻記錯了日子。

服部這次帶來的案件是五年前去世的犬伏集團會長的養子女們接二連三離奇死亡的事件，而且據說案件是由身上纏繞火焰像犬一樣的魔物所造成的，因為其中一名養子跟和葉的母親是舊識，于是柯南和服部一起登門拜訪探聽詳細情況，沒想到對方的名字竟然是工藤伸一與工藤新一讀音相似，在他們詢問之前，伸一竟然被人設計成一氧化碳中毒而亡，之后，前來調查的警方從死者口中發現了一顆掉落的珍珠，這會是死者留下的死亡訊息嗎？

小蘭和小五郎按照指示來到了車站，就在這時阿波羅發現了在車站里奇怪的男人并得到了接下來的線索U字。之后小蘭一行來到了接下來的提示的瓷器店而這時阿波羅和母親一起離開剩下小五郎和小蘭繼續尋找線索。第二天在警方的要求下小蘭眾人繼續破解沒有完全解開的暗號，而就在眾人解開暗號來到會場之后，柯南發現賽場上的米奈芭有些不對勁！

這兩人竟然是長野縣警官上原由衣和大和敢助，他們此次前來的目的是讓柯南和小五郎幫忙破解沾滿鮮血的赤壁之謎！于是一行人來到案發的希望之館，這里曾經住著六個很有才華的年輕人，自從三年前一名女性小葵心臟病發去世之后，她的丈夫明石周作就獨自一人留在館內生活，可是他卻被人鎖在館內的屋中活活餓死，如今能看到的只有他留下的奇特死亡訊息，這時，大和警官的死對頭諸伏高明警官也來到館內進行調查。

就在兇手企圖用球棒襲擊被騙到音樂室的小林老師時，他卻反過來被小林老師撂倒，這時，少年偵探團和白鳥警官出現，原來小林老師早已被白鳥警官所保護而眼前這個人正是佐藤警官，期間，小林老師想起了以前在書店發生的事情，誤會消除的二人重歸于好。麒麟角是鈴木次郎吉在山中寺廟發現的寶物，而基德又以此為目標出了預告函，次郎吉率領基德無法喬裝的少年偵探團以及進行直播的工作人員來到寺廟，麒麟像被藏在寺廟的立柱中間，想要拿取它并非易事……