正在用餐的毛利突然接到了一通電話(huà)，而打來(lái)的人是曾近因?yàn)殂y行搶劫而被毛利逮捕的冰室，在電話(huà)中冰室說(shuō)有一個(gè)人會(huì)因?yàn)槊廊ァＣc冰室沖突的一面被很多人目睹，而曾經(jīng)指正過(guò)冰室的沼尾不幸墜亡，毛利不光名聲受到了影響還間接為冰室做了不在場(chǎng)證明，看到整日酗酒的毛利后柯南準(zhǔn)備出場(chǎng)了。

在小蘭的跆拳道社學(xué)姐鏡堂奈奈美的邀請(qǐng)下，少年偵探團(tuán)的眾人來(lái)到了鏡堂家尋找傳聞中的寶藏，非常熱衷建筑的上一代家主鏡堂征太郎在這座宅邸中設(shè)下了各式各樣的機(jī)關(guān)，而沒(méi)有入口和窗戶(hù)的暗黑之塔也是其中之一，而在奈奈美帶領(lǐng)他們?cè)谡∷奶巺⒂^時(shí)突然聽(tīng)到了女性的慘叫聲，奈奈美的母親不幸從塔上墜亡，前去調(diào)查兇手的途中灰原卻不見(jiàn)了蹤影。

毛利收到的信件上寫(xiě)著有人要?dú)⒑γ佬g(shù)館館長(zhǎng)的內(nèi)容，前去拜訪(fǎng)的柯南等人目睹了好幾次差點(diǎn)讓館長(zhǎng)喪命的危機(jī)。而今天前來(lái)拜訪(fǎng)的赤座先生已經(jīng)被殺害，懷疑壬生小姐行跡可疑的柯南和小蘭正準(zhǔn)備親自聯(lián)絡(luò)警方的時(shí)候卻遭到了襲擊，美術(shù)館里的三個(gè)員工是共犯，而館長(zhǎng)現(xiàn)在將要面臨危險(xiǎn)。

看似自殺的案件還存在著很多疑點(diǎn)，現(xiàn)場(chǎng)留下的物件和快速轉(zhuǎn)臺(tái)的情況讓柯南明白了作案手法，而能夠作為決定性證據(jù)的物品還藏在真正的兇手身上。奶奶受到的訊息讓恩田的謊言不攻自破，而作為冒牌小五郎的他正處于尷尬的境地，察覺(jué)到背后隱情的柯南并不準(zhǔn)備揭穿他，柯南還準(zhǔn)備讓這個(gè)冒牌的小五郎展現(xiàn)名推理指出真正的兇手。

被初音小姐雇傭的偵探安室透在調(diào)查伴場(chǎng)先生時(shí)發(fā)現(xiàn)了一件事，初音小姐和伴場(chǎng)先生都是從同一間飯店獲救的嬰兒，兩人都是在身份不明的情況下在同一所教會(huì)中撫養(yǎng)長(zhǎng)大，聽(tīng)到這些之后的初音非常在意。所有的證據(jù)都指向了伴場(chǎng)先生，在車(chē)底找到初音小姐掉落指甲的柯南似乎看出了事情的真相，這背后或許有著令人悲傷的事實(shí)。