十四王爺心生惻隱之心，情急之中沖上前來與皇上閑談敘舊。皇上以半片金鎖設問王爺家事，引得冷眼旁觀的四姑娘憤憤不已。原來她與皇上有殺父之仇。皇上與王爺推杯換盞之際，忽然遭遇一群刺客。授命保駕的福康安率伏兵與之展開混戰。雖是兩主對陳，四姑娘的出手不凡還是深深地打動了福康安的心。 紀曉嵐以大內祭天的樂曲期望引起皇上的注意，莫愁警，迅速將之隔離，并趁機再次俘虜和。二人困在孤島之上，不免談天說地，無論是為官之術還是為人之道，紀曉嵐與和的見解都格格不入，雖然滔滔不絕，卻話不投機。用盡了心思，打碎了算盤，和棄紀曉嵐于不顧，兀自浮水沈生而去，驚魂未定，便與福康安密謀，一心要將調查云州貪污案的紀曉嵐置于死地，深恐他一旦自由，必定會對亦涉及此案的自己不利。 紀曉嵐被莫愁挾持到戲班，在后臺，他一邊憑借著驚人的記憶力默寫帳冊，一邊替不通文墨的小月書寫要上演的劇目招，那瀟灑自如的筆墨字跡張貼在人來人往熙熙攘攘的戲園門前，立刻引起了途經此地的皇上注意。

小月望著一片廢墟、傷心之極。從小春口中得知紀曉嵐等已從暗道逃走，小月破涕為笑。乾隆向百官念叨缺少銀兩以備軍需，紀曉嵐帶領著工匠出現，許諾可以幫乾隆解決難題。人證、物證俱在，齊蘇圖只得低頭認罪。銀妃以死要挾乾隆放過齊家。見乾隆不為所動，銀妃自盡。和珅為了擴大自己在朝中的勢力，暗中支持村夫李二組織邪教，從而謠言惑眾，籠絡人心。一時之間，朝廷內外盡是李二的信徒。工部因大做法事導致衙門失火。和珅答應撥款給工部金尚書以重修工部衙門。御史海升之妻組氏參加了當日作法，海升將失火原因告知了紀曉嵐。和珅同黨吳省蘭將作法用書《佛法心經》奉與皇上，并夸口只要通讀此書，便可百病不侵。和珅不失時機地推薦吳省蘭任左都御史。乾隆以紀曉嵐著成《四庫全書》為由，指派他上任左都御史，并對其寄予厚望。紀曉嵐上任之時，和珅的黨羽劉構傲慢無禮地當眾打坐，向紀曉嵐挑釁。紀曉嵐覺察出邪教實力強大，決定剝繭抽絲，調查到底。

和見風使舵，掉轉船頭出面逮捕了王旦望。近百名“監糧”案中的貪官落入法網。紀曉嵐絲毫不敢怠慢，而和卻在狡盡腦汁地尋找可乘之機，以彌補此番未敢謀取的物質損失。 邊亂平定，貪案水落石出，皇上龍顏大悅，重賞班師回朝的紀曉嵐、和等。夜來君臣閑坐，小月心口無忌，提及云州之行中所結識的金大爺，和懷恨在心，正欲讒言詆毀時，金大爺應聲而出，原來此人皇上特派，并非等閑之輩。 除弄權、貪財外，和還有“寡人之疾”--好色。私下召見已被羈押的王旦望之家眷，其義女蘇卿憐。喬張作致、虛情假意，妄圖將年輕貌美的才女占為己有。適逢紀曉嵐及時趕趕來，奉勸蘇姑娘好自為之，同時亦感謝姑娘千里之外的救命之恩。 和在得月樓設宴，江南道御史陳輝祖與共同譏諷姍姍遲到的紀曉嵐。面對挑釁，紀曉嵐不露聲色，反戈一擊。

紀曉嵐與和聯手派人護送御醫呂長安安在回京，這對多年來的冤家對頭即使在相互合作時也不忘反唇相譏，彼此嘲謔。 從呂長安之口，眾人才知四姑娘與十四王爺乃是藥方奇案的罪魁禍首，眼前紙包不住火，陰險毒辣的十四王爺決定丟卒保車，要四姑娘刺殺紀曉嵐后再自殺，以消滅罪跡，眼見自己忠心耿耿追隨的人竟如此冷酷無情，四姑娘徹底絕望，將一劑毒藥一飲而盡。 紫禁城內，皇上召見文武百官，和得意洋洋肆意表功，紀曉嵐巧設圈套，使和、福康安挪用貢品的不義之舉和此后協助自己調查藥方密案的合作之功一一道出，搞得二人一驚一乍。 十四王爺應召入宮見駕，藥方奇案終于到了真相大白的時候。

紀曉嵐堅持讓乾隆追查以抓出幕后主謀，乾隆認為紀曉嵐沒有真憑實據難以信服。趙青斥責乾隆昏庸，乾隆在和珅的挑唆下欲治她的罪，紀曉嵐甘愿替趙青接受懲罰。小月與趙青相互傾訴對紀曉嵐的情意，兩人盡釋前嫌，成為好姐妹。和珅傳旨紀曉嵐被革職。紀曉嵐頗感失意，詢問趙青是否愿意與自己歸隱山野。趙青以江山社稷為重，拒絕了紀曉嵐。兩人借酒澆愁，四目相對，不能自己。紀曉嵐酒醒之后發現趙青已不辭而別，不禁為自己一時沖動而懊悔不已。紀曉嵐帶乾隆來到香積庵，根據了凡寫在墻上的暗語，找到了被藏在佛像之下的財寶。