少年偵探團聽同學(xué)說她們家的房客中有一個十分刻板且循規(guī)蹈矩的男人，尤其是遇上亂扔垃圾的人就會對他們訓(xùn)斥一番，出于好奇，柯南他們便前去見這個叫巖田的先生。沒想到三天之后，巖田居然去警局自首說自己失手殺人，雖然是正當(dāng)防衛(wèi)不予追究，但警察還是對巖田的生活以及他的朋友等人進行了調(diào)查，卻發(fā)現(xiàn)事情并不像他描述的那么簡單。

柯南和灰原把撿到的貓還給飼主石上時，對面的高利貸事務(wù)所發(fā)生了命案，死者正是事務(wù)所的老板，他的后腦勺因遭到招財貓的重擊而死，柯南發(fā)現(xiàn)吸塵器的集塵袋被人拿走，并且還在沙發(fā)下找到了招財貓的爪子，警方將出現(xiàn)在現(xiàn)場的村井千佳小姐帶來，一番詢問，村井承認了自己的罪行，就在警察準(zhǔn)備帶走犯人時，柯南將小五郎麻醉道出了這件命案的真兇！

柯南在和大家一起吃壽司的時候?qū)⑿∥謇陕樽恚?dāng)面戳穿了前來領(lǐng)獎的兩名冒牌貨，幫胡桃找到了記憶中的少年。雖然這件事情成功解決，但是十五年前的連續(xù)殺人案卻依舊找不到眉目，案件將在三天后失效，可目前追查兇手的線索卻只有有兩條。在柯南一行人去步美家玩的時候，灰原說自己在這棟公寓里遇見了一個穿著大衣吹著口哨的男人，難道十五年前的殺人兇手出現(xiàn)了？

柯南、少年偵探團、哀、阿笠博士來到阿笠博士友人所在村莊觀光，在夜晚的溪邊等待放螢火蟲時，村長的兒子中嶺和助手垂水乘坐運送螢火蟲的貨車到達。垂水打開貨車上的箱子，螢火蟲便成群結(jié)隊的飛了出來。元太為了要抓螢火蟲，爬上了貨車，隨手拿走了貨車上的手電。在大家陶醉于欣賞螢火蟲時，助手垂水接到一通中嶺打來的電話，說中嶺在烏帽巖，救命。柯南等人到達時，發(fā)現(xiàn)中嶺已經(jīng)死在車內(nèi)，地上放著疑似有毒的飲料瓶，車內(nèi)還飛著一只……螢火蟲。。。

兇器是房間工具箱里的錘頭，并且柯南還發(fā)現(xiàn)每個人的房間都有薰衣草和工具箱，到底是誰做出這種安排？又是出于什么目的呢？既然是無人島，那么兇手一定就是這棟房子中的一人，之后柯南他們又對供電的小房子進行了調(diào)查，然而根據(jù)所找的線索，柯南，服部和白馬探每個人鎖定的嫌犯都不相同，即便如真相也只有一個！