受到服部的邀請(qǐng)，小五郎、小蘭和柯南前往大阪參加一個(gè)名為3K餐廳的開(kāi)幕酒會(huì)，餐廳老板是前職業(yè)拳擊手里卡巴雷、美國(guó)職棒投手邁克諾德和柯南的偶像職業(yè)足球選手雷卡迪斯三人，沒(méi)有想到就在柯南等人協(xié)助他們進(jìn)行一場(chǎng)秘密計(jì)劃的時(shí)候，槍聲突然響起，柯南和服部匆忙趕到發(fā)出槍聲的房間，發(fā)現(xiàn)美國(guó)報(bào)社記者埃德麥肯竟然被人槍殺橫尸屋內(nèi)，警方立刻對(duì)所有來(lái)賓進(jìn)行排查，另一邊服部發(fā)現(xiàn)柯南的表現(xiàn)很反常。

柯南等人循著灰原留下的記號(hào)一路尋找，因?yàn)閮词志驮谕械娜C人之中，灰原和光彥就在大樹(shù)下面留下一些散落的蘑菇作為暗號(hào)，躲在叢林里期望柯南能有所行動(dòng)制服兇手。柯南果然不負(fù)眾望，破解了灰原留下的暗號(hào)，正準(zhǔn)備麻醉兇手時(shí)，卻又有所猶豫，并大聲喊出了灰原和光彥，柯南到底有何用意？

柯南一開(kāi)始就知道兇手是誰(shuí)，但他卻苦于找不到證據(jù)，然而當(dāng)他無(wú)意間看到勒在素夫脖子上的領(lǐng)帶，沒(méi)錯(cuò)，證據(jù)就是這個(gè)！另一邊，目暮警官發(fā)現(xiàn)素夫死前所買(mǎi)保險(xiǎn)的受益人是菊代，而且在素夫消失的這段時(shí)間她也曾來(lái)過(guò)倉(cāng)庫(kù)以及根據(jù)美濃所提供的證詞，這一切線索不得不讓警方懷疑殺死素夫的兇手就是菊代，而菊代也是百口莫辯。這時(shí)，柯南將園子麻醉，借助變聲器將事情的真相一一道出！

旅館主人紫郎和弟弟金次迎接了來(lái)到“痊愈的森林”的柯南一行人，途中，柯南他們遇到了兄弟倆的父親龍藏，龍藏的蠻不講理讓柯南他們吃驚不小，但因牛奶投遞員藍(lán)子的出現(xiàn)，氣氛緩和許多。但就在幾小時(shí)后，龍藏在自己家被人殺害了。在調(diào)查現(xiàn)場(chǎng)后柯南找出了殺害龍藏的兇手，其實(shí)就是自己的親人，因?yàn)榈貌坏礁赣H贊同和支持而疼下殺手。

為了救被綁架的詹姆斯，少年偵探團(tuán)努力推理他留下的“P&A”的意思。步美把自己的偵探徽章留在了詹姆斯那里使眾人得到了詹姆斯的鎖在位置。他們還得到了佐藤警官等的幫助，向犯人發(fā)起追擊。而經(jīng)過(guò)推理，柯南領(lǐng)會(huì)到詹姆斯信息原來(lái)指的是自己被綁架到假冒的警車(chē)之中。而為了確保詹姆斯的安全，柯南眾人采取了非常的營(yíng)救手段。