簡(jiǎn)單問(wèn)過(guò)案情之后，小五郎隨警方來(lái)到案發(fā)的二樓進(jìn)行查看，根據(jù)死者頭部的槍傷，推斷出兇手的身高應(yīng)該在在180cm左右，雖然船本先生有嫌疑但卻低于死者，種種推斷都否決了船本殺人的可能，然而，柯南卻在他輪椅上發(fā)現(xiàn)了蔥，沒(méi)錯(cuò)，兇手就是他，可是他到底是如何犯案？消失的珍珠項(xiàng)鏈又被如何處理了？

兇器是房間工具箱里的錘頭，并且柯南還發(fā)現(xiàn)每個(gè)人的房間都有薰衣草和工具箱，到底是誰(shuí)做出這種安排？又是出于什么目的呢？既然是無(wú)人島，那么兇手一定就是這棟房子中的一人，之后柯南他們又對(duì)供電的小房子進(jìn)行了調(diào)查，然而根據(jù)所找的線(xiàn)索，柯南，服部和白馬探每個(gè)人鎖定的嫌犯都不相同，即便如真相也只有一個(gè)！

柯南他們很快就找到了被害者們常去的麻將館，并從老板那里得知，曾有一個(gè)叫鬼保獨(dú)郎的人與平棟堂次發(fā)生過(guò)沖突，抓到嫌疑犯后，高木警官便前去找曾聽(tīng)到兇手聲音的鍋井永貴做指認(rèn)，沒(méi)想剛進(jìn)門(mén)就被人打昏。另一邊，柯南因?yàn)椴矫酪痪渫嫘υ?huà)，突然想通了Z的含義并說(shuō)兇案早在十五年前就結(jié)束了，此次兇案的發(fā)生不過(guò)是模仿犯所為而兇手就在被害者的家屬之中。

少年偵探團(tuán)一行人坐阿笠博士的車(chē)去露營(yíng)，但車(chē)子因?yàn)闆](méi)油停在了半路而進(jìn)退兩難，正好古董車(chē)車(chē)主周藤豪貴路過(guò)此地，他不但沒(méi)有幫助柯南他們還留下了狠毒的話(huà)離開(kāi)，沒(méi)過(guò)多久山上的別墅發(fā)生了爆炸事件，當(dāng)大家趕到時(shí)，看到的卻是在熊熊大火中燃燒的古董車(chē)和他悲痛欲絕的未婚妻銀林惠奈，乍看似乎是起意外事故，可惠奈的態(tài)度引起了柯南的懷疑，難道兇手就是她？

園子的叔叔次郎吉因?yàn)樽ゲ坏交露肇瑝?mèng)纏身，于是，他再次策劃了基德抓捕計(jì)劃，這次他以寶石涼鞋“紫色指甲”為誘餌，并將展示臺(tái)設(shè)在基德不能使用滑翔翼的銀座正中央地面上，在粉絲們的期待下基德出現(xiàn)并成功拿到寶石，就在這時(shí)，四個(gè)路口被巨大的網(wǎng)子隔開(kāi)，猶如籠中鳥(niǎo)的基德從容不迫，放出煙霧后瞬間移動(dòng)到了30公尺高的大樓，因?yàn)槠渲幸活w寶石是贗品，于是他宣布自己次日還會(huì)再來(lái)。