死者被殺時(shí)手里握著剪刀，尸體的傷口處還粘滿了蜂蜜，不僅如此，案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的水龍頭還一直開著，柯南和昴確定兇手就是零食店的仙波先生，但他們還一時(shí)半會(huì)兒找不到兇器。在詢問(wèn)了保鏢后柯南有了一些線索，阿笠博士在院子里看到的成群螞蟻也為他們提供了幫助，兇手到底是運(yùn)用了什么手法來(lái)作案的呢？

柯南等人來(lái)到方斗寺調(diào)查會(huì)預(yù)知未來(lái)的佛像一事，因天色已晚便決定在寺院內(nèi)留宿。正當(dāng)眾人享用晚飯時(shí)，突然從房?jī)?nèi)傳出一聲慘叫，原來(lái)是正在房中念經(jīng)的住持被人殺害。毛利小五郎通過(guò)柯南在院內(nèi)找到的一些線索，推斷出了兇手的身份，然而正當(dāng)兇手跪地坦白自己的罪行時(shí)，柯南突然發(fā)現(xiàn)案件并沒(méi)有結(jié)束……

根據(jù)死者背包中的贓物，秀一判斷該死者可能是一名搶劫犯，同時(shí)他發(fā)現(xiàn)還有一名嫌疑犯在逃?？履显谛慵膸椭聨?lái)了三名有作案嫌疑的游客，經(jīng)過(guò)秀一的推理，真相很快浮出水面，警方也順利抓獲了犯罪嫌疑人。至此，柯南終于回憶起十年前與世良初次相遇的情景，同時(shí)他也意識(shí)到，世良可能已經(jīng)知曉自己的真實(shí)身份。

唐三為小舞梳頭，不由地聊起了各自的家庭，兩個(gè)人越聊越投機(jī)，小舞高高興興去吃飯，王圣等人趕忙湊過(guò)來(lái)好奇地問(wèn)東問(wèn)西，唐三心里坦蕩蕩，他夸小舞是一個(gè)很單純的姑娘。蕭塵宇派柳龍?jiān)谂鷮嬍艺伊艘淮笕?，也不?jiàn)小舞的人影，沒(méi)想到小舞竟然住在七舍，而且還是這里的老大，蕭塵宇大為惱火。小舞興沖沖拉著唐三去食堂吃飯，蕭塵宇邀請(qǐng)小舞去魂師會(huì)館吃好吃的，小舞根本不領(lǐng)情，柳龍沖小舞大呼小叫，要強(qiáng)行拉她走，小舞飛起一腳把柳龍打翻在地，蕭塵宇惱羞成怒，還搬出苑長(zhǎng)是他三叔來(lái)說(shuō)事，唐三根本不買賬，拉起小舞就去食堂吃飯了。理論課考試的時(shí)候，柳龍不會(huì)答題，就搶了王圣的卷子，還倒打一耙，誣陷王圣作弊，唐三和小舞站出來(lái)揭穿柳龍，監(jiān)考老師不容分說(shuō)把柳龍和王圣趕出去。接下來(lái)就是武魂格斗課，教官讓蕭塵宇給同學(xué)們做示范，蕭塵宇讓唐三做他的搭檔，其實(shí)就是想讓唐三當(dāng)活靶子，趁此機(jī)會(huì)好好教訓(xùn)唐三，蕭塵宇揮拳擊打唐三胸口，他被打得站立不穩(wěn)差點(diǎn)摔倒，蕭塵宇步步緊逼，招招致命，一一被唐三巧妙化解，兩個(gè)學(xué)員分別死死拉住唐三的手臂，蕭塵宇揮拳狠狠打向他的腹部，唐三紋絲不動(dòng)，蕭塵宇感覺(jué)有一股巨大的反擊力量，十分驚訝唐三如何反擊的。教官讓學(xué)員們擊打沙袋練

柯南所在的班里來(lái)了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫線，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉(cāng)庫(kù)里可能有石灰，元太和光彥開玩笑說(shuō)舊倉(cāng)庫(kù)有幽靈出沒(méi)，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉(cāng)庫(kù)。在尋找石灰的過(guò)程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門，眾人合力打開門后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……