小五郎應(yīng)畫(huà)家花岡之邀前來(lái)談話，可是等了許久仍沒(méi)見(jiàn)到花岡的身影，就在小五郎生氣要離開(kāi)時(shí)花岡出現(xiàn)，與此同時(shí)，另一位住在對(duì)面的女插畫(huà)家蝶野打來(lái)電話說(shuō)要自殺，柯南等人親眼看到蝶野從樓下墜落，趕到現(xiàn)場(chǎng)時(shí)蝶野已死，而這個(gè)看似自殺的案件其實(shí)是他人謀殺，兇手就是花岡，可蝶野從樓上跳下時(shí)，花岡正和大家在一起，他到底是怎么做到的？

柯南和伙伴們?nèi)ッ佬g(shù)館時(shí)撿到了一張畫(huà)有奇怪符號(hào)的紙，大家自行成立少年偵探團(tuán)去調(diào)查這些暗號(hào)，按照符號(hào)的指示先到達(dá)東京塔，在周?chē)归_(kāi)偵查卻一無(wú)所獲，休息的時(shí)候步美的新發(fā)現(xiàn)為柯南找到破解暗號(hào)的出口，大家一路尋找從東京鐵塔到南部水族館的標(biāo)記，然而，事情并非那樣順利，柯南能破解暗號(hào)嗎？暗中跟蹤少年偵探團(tuán)的黑衣人又是誰(shuí)？

柯南去體育俱樂(lè)部館參觀時(shí)，正巧看到水上運(yùn)動(dòng)的西條、成瀨和木島發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)的一幕，而體育俱樂(lè)部負(fù)責(zé)人佐伯和跳水代表西條也存在著某些不愉快。當(dāng)晚，小五郎接到目暮警官的電話說(shuō)西條死亡，因?yàn)闆](méi)找到什么有用的線索，警方準(zhǔn)備以意外死亡結(jié)案，可是柯南注意到這是件謀殺案，柯南找到目擊證人并從他的繪畫(huà)中看透事情的真相，兇手一定就是那個(gè)人。

柯南要陪步美拔牙時(shí)，被葉子醫(yī)生婉拒。而當(dāng)晚七點(diǎn)半不動(dòng)產(chǎn)老板中本被殺，發(fā)現(xiàn)尸體的人就是葉子和管理員，雖然葉子有殺人的動(dòng)機(jī)，但由于步美的證詞，葉子有不在場(chǎng)的證明，因?yàn)樗菚r(shí)正在陪步美看七點(diǎn)半開(kāi)始的假面超人。柯南一人在葉子家附近調(diào)查，看到葉子家和診所一樣的窗簾，柯南便知道了葉子的手法，并且那副假面超人的撲克也成了重要的證據(jù)。

這個(gè)從天而降死亡的人是江源，但從領(lǐng)結(jié)和皮帶等細(xì)節(jié)可以看出暗夜公爵并不是江源，警察去江源房間搜查時(shí)，發(fā)現(xiàn)房門(mén)居然上有防盜鎖，兇手把江源推下后是怎么逃脫的？在警察對(duì)其他人偵訊時(shí)，暗夜公爵將看守江源尸體的空手道高手打昏，還出現(xiàn)在了柯南、小蘭和佐山面前，并完全躲開(kāi)了小蘭攻擊，難道說(shuō)兇手就是……