目睹柯南墜崖的眾人陷入了痛苦和無助之中，警察署的搜查工作也一籌莫展，然而小哀卻覺得此事另有蹊蹺，便獨(dú)自上路尋找柯南。另一方面伊勢(shì)原在柯南的幫助下成功脫險(xiǎn)，二人在山中的木屋與小哀相遇。在三人的設(shè)計(jì)和警方的幫助下，抓捕佐羅的行動(dòng)圓滿完成。正當(dāng)眾人以為此事已畫上句點(diǎn)時(shí)，柯南卻發(fā)現(xiàn)案件仍有疑點(diǎn)……

柯南從無人機(jī)上墜落后便失去了犯人的線索，就在眾人一籌莫展的時(shí)候佐藤警官打來電話，她稱發(fā)現(xiàn)了犯人。佐藤警官上前拘捕犯人卻反被挾持，柯南和高木等人趕到后協(xié)力制服了犯人，但手提包內(nèi)的1億日元卻不翼而飛。另一方面，本該被綁架的麻奈美小姐正在美術(shù)館欣賞裕之的作品，而這背后到底是誰在搞鬼？

為了紀(jì)念戰(zhàn)國(guó)武將信長(zhǎng)入主岐阜城450周年，偵探少年團(tuán)和阿笠博士來到岐阜市內(nèi)游玩。在光彥的提議下，眾人共同觀看了當(dāng)?shù)氐挠⑿坌惚硌荨１硌萁Y(jié)束后，光彥因想得到簽名而獨(dú)自返回觀看場(chǎng)所，然而他卻在尋找表演人員的過程中遭到綁架……與此同時(shí)，在博物館展出的信長(zhǎng)公像也一并失竊。光彥能否獲救？柯南眾人尋盡線索，希望迅速找出幕后黑手。

米小圈在電視上看到小區(qū)大娘的寵物狗丟了，看來小區(qū)附近有偷狗賊，米小圈非常驚慌地跑出去看耗子，剛好姜小牙也在，姜小牙總是來看耗子，現(xiàn)在不會(huì)再偷偷將它帶回家了，鐵頭也看了電視，匆匆忙忙來找耗子，三個(gè)人都這么關(guān)心寵物狗，鐵頭聽到米小圈同意他作孩子的哥哥，起初還很開心，當(dāng)聽到姜小牙和米小圈都作了耗子的爸爸時(shí)，頓時(shí)不開心了，三個(gè)人的關(guān)系這么鐵，現(xiàn)在直接差輩了。三個(gè)人正說著，忽然發(fā)現(xiàn)狗沒了，之后匆匆忙忙去找狗，卻在小區(qū)另一側(cè)，中央公園門口一個(gè)老大爺騎車帶著耗子悠閑而去。米小圈和姜小牙鐵頭就這樣看著耗子被帶走，他們立刻給警察叔叔報(bào)了警，之后尾隨狗販子看要將狗帶去哪里。他們一路跟著到了一處小院，親眼看到耗子被關(guān)了進(jìn)去，米小圈和姜小牙和鐵頭商量采用聲東擊西的方法引開爺爺，之后再偷偷潛入院子將耗子偷走。鐵頭哭不出來，姜小牙便幫忙在他大腿處狠狠掐了一把，終于鐵頭疼得哇哇大哭。鐵頭哭著稱自己找不到家，老大爺便帶著他去找家，米小圈和姜小牙便悄悄溜進(jìn)院子，將耗子給抱了起來，姜小牙被一盆粉紅色的面團(tuán)吸引，伸手去捏了捏，竟然整雙手都被陷了過去，米小圈趕過去幫忙，兩人都被面團(tuán)黏住了。就這樣錯(cuò)過了偷跑的最佳時(shí)機(jī)，不一會(huì)兒

一天，李黎給米小圈出了一道腦筋急轉(zhuǎn)彎，一道題里面有十個(gè)大爺，問哪個(gè)大爺偷了錢，米小圈正絞盡腦汁想到底哪個(gè)大爺偷走了錢，還讓同學(xué)們紛紛出來情景演繹，就在這個(gè)時(shí)候，班級(jí)里忽然來了不速之客，對(duì)方小小的個(gè)字，說話卻非常苛刻，并且對(duì)同學(xué)滿臉不屑，米小圈對(duì)這個(gè)不懂禮貌的小屁孩非常反感，就在這個(gè)時(shí)候班主任魏老師來了，給班上的同學(xué)介紹，這時(shí)他們班新傳來的學(xué)生王聰聰。聽說這個(gè)王聰聰總是跳級(jí)，從一年級(jí)直接跳到三年級(jí)，貌似天資異稟，智能超強(qiáng)，米小圈才對(duì)此不感冒，沒過幾天，語文老師提到民間習(xí)俗對(duì)對(duì)聯(lián)，米小圈本來對(duì)自己的對(duì)子特別自信，可是王聰聰話音一轉(zhuǎn)，直接成了公然嘲諷，同學(xué)們立刻哄堂大笑。米小圈也有了新的綽號(hào)“方大方”，米小圈對(duì)新來的同學(xué)恨得咬牙切齒。沒過幾天，姜小牙在課間吹噓父親剛剛買了新車，家里又碩大的別墅，這輛新車只是開進(jìn)院子就需要半個(gè)小時(shí)。旁邊一直有小朋友發(fā)出驚訝艷羨的感嘆，王聰聰卻笑問有一樣?xùn)|西，上可以貼著天，下可以貼著地，問這樣?xùn)|西是什么，眾人開始迷惑不解，王聰聰抑郁成績(jī)，就是嘴巴。大伙哄然大笑，姜小牙的臉都綠了。米小圈和姜小牙對(duì)王聰聰恨得牙齒癢癢，他們慫恿李黎統(tǒng)一戰(zhàn)線也給王聰聰一點(diǎn)厲害，但王聰聰