不久，王聰聰父親來(lái)找魏老師要求轉(zhuǎn)學(xué)，還將那本畫(huà)有漫畫(huà)的書(shū)拿給老師看，王聰聰父親覺(jué)得秋實(shí)小學(xué)的文化氛圍不行，米小圈和姜小牙以及鐵頭聽(tīng)到非常驚訝，好不容易建立起來(lái)的友誼現(xiàn)在卻要中斷，他們給王聰聰辦了熱烈的歡送會(huì)。一天，米小圈的父親接到一個(gè)電話(huà)，是王聰聰父親打來(lái)的，兒子被帶回家自學(xué)，將自己關(guān)在書(shū)房很多天，不吃不喝，只提出要見(jiàn)米小圈，王聰聰父親趕緊把米小圈叫去，米小圈幾個(gè)鬼臉做完，王聰聰變又樂(lè)不可支了。經(jīng)過(guò)這件事，王聰聰父親開(kāi)始反省自己平時(shí)給米小圈的壓力太大，準(zhǔn)備今后帶他經(jīng)常出去玩玩，王聰聰終于肯出門(mén)了，平時(shí)在父親的高壓下學(xué)習(xí)，差點(diǎn)造成抑郁。而米小圈的父親覺(jué)得自己兒子非常健康，但是去到王聰聰家后，面對(duì)滿(mǎn)墻的獎(jiǎng)狀，他也開(kāi)始反省，是不是自己“散養(yǎng)”的教育方式才讓米小圈沒(méi)有王聰聰優(yōu)秀，從王聰聰家回去，米小圈父親也特意騰出一間房子作書(shū)房，滿(mǎn)墻的書(shū)籍，滿(mǎn)墻的名人札記，米小圈看了直接嚇得暈倒！這天，米爸開(kāi)心地宣布他們一家要到新馬泰旅游，米小圈興奮地向全班同學(xué)宣布，終于有吹牛的資本了，再也不被姜小牙比下去，可是萬(wàn)萬(wàn)沒(méi)有料到，父親訂單的旅游景點(diǎn)是在中國(guó)，并且標(biāo)準(zhǔn)的農(nóng)家樂(lè)，只是名字起得如此大氣，米小圈大失所望，

小五郎讓柯南和小蘭陪他一起去位于大分的別府溫泉旅行，說(shuō)到別府溫泉最有名的莫過(guò)于地獄巡游之旅，就在小蘭和柯南興致勃勃討論的時(shí)候小五郎卻在一旁默不作聲。在柯南和小蘭的逼問(wèn)下小五郎才說(shuō)出了實(shí)情，這次的旅行目的是尋找仲代電氣社長(zhǎng)的女兒麻奈美，柯南根據(jù)照片找到了麻奈美所住的旅館，但這僅僅只是開(kāi)始。

毛利小五郎帶柯南和小蘭來(lái)高級(jí)餐廳用餐，進(jìn)門(mén)后三人發(fā)現(xiàn)桌上擺滿(mǎn)了食物卻沒(méi)有客人，并在廚房發(fā)現(xiàn)了倒在地上的廚師口石先生。清醒后的口石先生告訴三人，原本有五名客人在餐廳里用餐，不料自己在做飯時(shí)遭到了歹徒的襲擊，客人們也不知去向。毛利小五郎馬上通知了目暮警官，并查清了每個(gè)客人的身份，然而卻難以判斷消失的客人們?nèi)チ撕翁帯Ｕ谶@時(shí)，擺放在餐桌上的甜點(diǎn)和雜物引起了柯南的注意。

利用步美找到的暗號(hào)解讀表，柯南本以為能順利解開(kāi)暗號(hào)，不料卻遇到了瓶頸。正當(dāng)此時(shí)，若狹老師再次拜托少年偵探團(tuán)前往舊倉(cāng)庫(kù)尋找石灰。來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)的眾人發(fā)現(xiàn)倉(cāng)庫(kù)一片狼藉，在若狹老師不經(jīng)意的提示下，柯南終于解開(kāi)了暗號(hào)的含義，并推測(cè)犯人將再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)。為了避免打草驚蛇，柯南設(shè)計(jì)誤導(dǎo)犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)，柯南能否順利將犯人一網(wǎng)打盡？

柯南確信被警察盯上的千野并不是真正的犯人，而尸體的第一發(fā)現(xiàn)者福田先生和催促番藤與天城協(xié)商的江崎小姐都有殺人的機(jī)會(huì)，但在調(diào)查中柯南并沒(méi)有得到這方面的線索。案件的條理逐漸明確，犯人殺死天城和番藤的目的是為了陷害千野，想起千野偶爾擔(dān)任推理小說(shuō)新人獎(jiǎng)的審查后另一條線索出現(xiàn)了。