受宿里村村長(zhǎng)之邀，柯南和平次等人共同前往宿里村尋寶。到達(dá)旅店后，通過(guò)與其他幾位考古學(xué)家和歷史學(xué)家交談，他們得知在寶藏的埋藏之處曾發(fā)生過(guò)塌方事故，其中一位外國(guó)挖掘隊(duì)員在彌留之際寫(xiě)下了意為“鵺”的字條，而鵺正是傳說(shuō)中極為兇猛的怪獸。飯后當(dāng)眾人準(zhǔn)備回房休息，平次卻突然發(fā)現(xiàn)門(mén)前失火，眾人在火中看到了體型巨大的怪獸。為了一探究竟的柯南和平次在追蹤怪獸的過(guò)程中，卻發(fā)現(xiàn)了倒在血泊中已經(jīng)喪命的歷史學(xué)家。

毛利小五郎受久須美工械廠社長(zhǎng)的委托，調(diào)查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對(duì)職員們暗中調(diào)查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對(duì)象，三人計(jì)劃在倉(cāng)庫(kù)抓住罪犯的現(xiàn)行，不料卻發(fā)現(xiàn)谷崎死在了反鎖的房間里。正當(dāng)案件一籌莫展時(shí)，谷崎生前研究的老鼠機(jī)器人引起了柯南的注意。

混凝土殺人事件還未解決網(wǎng)上就已經(jīng)鬧得沸沸揚(yáng)揚(yáng)，說(shuō)是案件真兇是外星人而警察在故意隱瞞外星人的存在，將案件告訴過(guò)毛利小五郎的千葉警官為此被訓(xùn)斥了一番?？履峡梢源_定的是這起案件是人為的殺人事件，在走訪犯罪嫌疑人朽木后柯南有了線索，到底朽木是用什么方法殺了被害人呢？

小蘭的母親妃英理在自己的事務(wù)所突然被人綁架，但她趁綁匪不注意躲進(jìn)了廢棄的大樓內(nèi)，并用搶來(lái)的手機(jī)向小蘭求救，雖然遭到了綁匪的干擾但柯南還是分辨出來(lái)了妃英理所發(fā)的信息內(nèi)容，從中獲得了一些線索后柯南帶領(lǐng)小蘭和小五郎立刻展開(kāi)救援，但被綁架的地點(diǎn)可能有兩處，柯南能在危急時(shí)刻找到正確的位置嗎？

唐三放心不下父親唐昊，知道他是因?yàn)樗寄钏廊サ钠拮尤貌湃杖战杈茲渤?，唐昊借口回?lái)拿那根針，和唐昊依依惜別，唐昊答應(yīng)以后不再喝酒，對(duì)唐三千叮嚀萬(wàn)囑咐，唐三發(fā)誓要做最厲害的魂師，希望學(xué)成歸來(lái)唐昊能把母親的事全部告訴他。村長(zhǎng)帶著唐三很快來(lái)到諾丁魂師學(xué)苑，自稱(chēng)大師的玉小剛在門(mén)口悠然自得看書(shū)，他檢驗(yàn)了唐三的武魂就放行，學(xué)員柳龍卻攔住了唐三，對(duì)他冷嘲熱諷一番，逼他拿出推薦信，唐三沒(méi)有推薦信，素云濤事先給了他一塊武魂殿的推薦令，讓他直接來(lái)學(xué)苑當(dāng)附課生，而且學(xué)費(fèi)和食宿全免，柳龍對(duì)唐三出言不遜，要把村長(zhǎng)趕走。蕭塵宇及時(shí)趕來(lái)為唐三解圍，他是諾丁城城主的兒子，是唐三的同門(mén)，熱情歡迎他入學(xué)，還幫他安排好宿舍，村長(zhǎng)才放心離開(kāi)了。蕭塵宇聽(tīng)說(shuō)唐三是武魂殿推薦的，斷定他的武魂是很特別的，唐三承認(rèn)是藍(lán)銀草，柳龍對(duì)這個(gè)廢武魂嗤之以鼻，唐三自詡天生滿武魂，蕭塵宇和柳龍立刻驚呆了，斗羅大陸上很少有人擁有天生滿武魂。玉小剛立刻追上唐三，根據(jù)他的研究推測(cè)唐三應(yīng)該不止一個(gè)武魂，所以他苦苦追問(wèn)唐三的另一個(gè)武魂，唐三想起父親的囑托，他找各種借口掩飾，玉小剛知道他在說(shuō)謊，也沒(méi)有多問(wèn)，就帶他去辦入學(xué)禮，還簡(jiǎn)單介紹了學(xué)苑的情況，玉小剛讓唐三