少年偵探團(tuán)在兒童跑腿活動(dòng)中，充當(dāng)活動(dòng)記錄。一行人跟在兒童小宏后面攝影，可是小宏總是亂跑，期間還曾跑進(jìn)過(guò)，一幢將要拆掉的廢棄大樓里，小宏在躲過(guò)了兩次人為制造的意外后，被人擄走，柯南從記錄的中發(fā)現(xiàn)了蛛絲馬跡，他們來(lái)到廢棄大樓，并在地下室找到了小宏和一具尸體，這時(shí)，兇手將少年偵探團(tuán)關(guān)到樓中，而外面拆除大樓已經(jīng)開(kāi)始，少年偵探團(tuán)能否逃過(guò)一劫？

阿笠博士帶少年偵探團(tuán)來(lái)到野外，并交給他們一張地圖讓他們?nèi)ふ覍毑兀飞侠щy重重，但大家不畏艱險(xiǎn)互相扶持，終于接近終點(diǎn)，柯南解開(kāi)天之水與天之石的暗語(yǔ)，順利找到了藏有寶物的底下通道，這里有兩大袋珠寶，然而在途中碰到過(guò)的兩個(gè)行跡可疑的男人突然出現(xiàn)，柯南采用智斗將他們打到后，又發(fā)現(xiàn)了一個(gè)大木箱，這才是阿笠博士想讓他們找到的寶藏。

大家一起去滑雪的時(shí)候，小五郎弄丟了別墅的鑰匙，三人正愁沒(méi)地兒住的時(shí)候，醫(yī)科大學(xué)的大山教授認(rèn)出小五郎并邀請(qǐng)他們?nèi)プ约旱膭e墅，并正巧碰上了大山教授學(xué)子們的聚會(huì)，期間，中原驅(qū)車(chē)下山買(mǎi)下酒菜，趁這個(gè)機(jī)會(huì)大家也都各自活動(dòng)，可中原回來(lái)后，卻發(fā)現(xiàn)大山教授被殺，柯南在現(xiàn)場(chǎng)根據(jù)教授留下的線索找到兇手。

園子和小蘭被邀請(qǐng)去皆川家參加情人節(jié)派對(duì)，柯南悄悄尾隨卻被發(fā)現(xiàn)。皆川的母親熱情招待各位，但皆川卻是一副不耐煩的樣子，他拒絕了青梅竹馬關(guān)谷香的巧克力，又對(duì)直道和若松冷嘲熱諷，狀態(tài)不佳的他決定外出透氣，他的心儀對(duì)象好美也一起跟去，突然一聲尖叫，皆川倒在了草坪上，到底是誰(shuí)在情人節(jié)制造了慘劇？

小蘭受邀來(lái)到園子家的別墅，參加園子的姐姐綾子大學(xué)電影社的社員的聚會(huì)。被太田邀請(qǐng)?jiān)谟曛猩⒉叫√m，突然遭到神秘繃帶男的襲擊，還好柯南等人趕到小蘭才免遭傷害，大家決定報(bào)警可電話卻打不通，而門(mén)外的吊橋也被人砍斷，接著大家看到繃帶怪人擄走知佳子，并森林里找了知佳子被肢解的尸體，深夜，繃帶怪人潛入小蘭房間，想要置小蘭于死地。