夜晚園子心血來(lái)潮帶著小蘭和柯南來(lái)公園里觀賞銀河，不料卻在花壇里發(fā)現(xiàn)了一起行兇案。園子透過望遠(yuǎn)鏡看到了一雙女子的手，她手上的戒指正在被兇手摘下，園子過于震驚沒有看到兇手的長(zhǎng)相。之后園子大概確定了行兇案的方向，帶著小蘭和柯南組成女高中生偵探團(tuán)去破解這樁行兇案。

柯南醒來(lái)后發(fā)現(xiàn)自己身在一個(gè)狹小黑暗的空間里，眼睛漸漸習(xí)慣后他才發(fā)現(xiàn)自己被困在了棺材里，能聽到風(fēng)聲這一點(diǎn)證明他還沒被埋起來(lái)，暈倒前的一幕幕也漸漸想了起來(lái)。毛利小五郎最近接到了一起案子，律師事務(wù)所保險(xiǎn)柜被撬，存放在里面的遺囑不見了，這是過世的塘橋集團(tuán)會(huì)長(zhǎng)的遺囑，這件事與柯南的遭遇是否有聯(lián)系呢？

利用步美找到的暗號(hào)解讀表，柯南本以為能順利解開暗號(hào)，不料卻遇到了瓶頸。正當(dāng)此時(shí)，若狹老師再次拜托少年偵探團(tuán)前往舊倉(cāng)庫(kù)尋找石灰。來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)的眾人發(fā)現(xiàn)倉(cāng)庫(kù)一片狼藉，在若狹老師不經(jīng)意的提示下，柯南終于解開了暗號(hào)的含義，并推測(cè)犯人將再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)。為了避免打草驚蛇，柯南設(shè)計(jì)誤導(dǎo)犯人，并在深夜與若狹老師等人再次來(lái)到舊倉(cāng)庫(kù)，柯南能否順利將犯人一網(wǎng)打盡？

根據(jù)死者背包中的贓物，秀一判斷該死者可能是一名搶劫犯，同時(shí)他發(fā)現(xiàn)還有一名嫌疑犯在逃?？履显谛慵膸椭聨?lái)了三名有作案嫌疑的游客，經(jīng)過秀一的推理，真相很快浮出水面，警方也順利抓獲了犯罪嫌疑人。至此，柯南終于回憶起十年前與世良初次相遇的情景，同時(shí)他也意識(shí)到，世良可能已經(jīng)知曉自己的真實(shí)身份。

為了打開藏有珍貴月長(zhǎng)石的機(jī)關(guān)盒，鈴木次吉郎準(zhǔn)備在鈴木大圖書館將機(jī)關(guān)盒展出，并邀請(qǐng)各界人士前來(lái)打開機(jī)關(guān)盒。同時(shí)，他也向怪盜基德發(fā)出了邀請(qǐng)，希望借此機(jī)會(huì)吸引基德并將其繩之以法。收到邀請(qǐng)函的基德如約而至，正當(dāng)眾人專心致力于打開機(jī)關(guān)盒時(shí)，基德已偷偷偽裝成其他人的模樣伺機(jī)以動(dòng)?？履夏芊耥樌页龌抡嫔?？