柯南回家后小蘭就告訴他，自從放寒假瑛祐就失去了聯(lián)系，而在此之前小蘭從他那里聽(tīng)說(shuō)，他好像在杯戶中央醫(yī)院找姐姐的時(shí)候發(fā)現(xiàn)了關(guān)于自己父親線索，柯南急忙找到茱蒂老師商量對(duì)策，并推斷出他的父親就是被黑暗組織殺掉的CIA諜報(bào)人員，隨后，柯南一行人趕到醫(yī)院向護(hù)士詢問(wèn)英祐的事情，沒(méi)想到竟然還有另一個(gè)人像英祐一樣在這家醫(yī)院打聽(tīng)水無(wú)憐奈的事情。

555 鸛的探索之旅（追蹤陽(yáng)菜篇）日文名字：こうのとりミステリーツアー（陽(yáng)菜追跡編）對(duì)應(yīng)漫畫(huà)：動(dòng)畫(huà)原創(chuàng)收視率：10.9%播映時(shí)間：2009年11月14日簡(jiǎn)介：住院的陽(yáng)菜逃出醫(yī)院后乘上出租車。平次一邊聯(lián)絡(luò)在旅館的柯南，同時(shí)坐上出租車追蹤陽(yáng)菜。和葉，少年偵探團(tuán)，哀也乘坐其他的出租車緊隨其后。柯南推理認(rèn)為陽(yáng)菜把“彩虹之子”藏匿在某處，并猜測(cè)她正往那邊趕去。被關(guān)在車后備箱內(nèi)的小蘭用BD徽章聯(lián)絡(luò)元太等人。柯南依靠徽章傳來(lái)的聲音推測(cè)小蘭所在的位置，然而…。

死羅神和服部一唱一和，兩人一起揭穿了假新一的身份并且還將當(dāng)年村長(zhǎng)及其妻子遇害一案再次向大家說(shuō)明，而這個(gè)死羅神自然也就是工藤新一本人。案件結(jié)束后，新一的身體再次發(fā)生變化，幸虧灰原的及時(shí)趕到，新一才保住了秘密不被發(fā)現(xiàn)，在驅(qū)車回家的途中，一輛車很危險(xiǎn)的在馬路上行駛，當(dāng)大家努力將其攔下后卻發(fā)現(xiàn)開(kāi)車的人已被人勒死。

柯南等人急匆匆的跑去米花公園的池塘里看被人丟棄的咬人龜，期間，他們遇見(jiàn)一個(gè)冒牌飼主二本松，雖被識(shí)破但他還是用花言巧語(yǔ)騙過(guò)了光彥等人，可讓他沒(méi)想到的是池塘里居然會(huì)冒出四只咬人龜，不知出于什么目的，他決定全部收養(yǎng)，柯南覺(jué)得二本松的行為很可疑，于是就暗中進(jìn)行調(diào)查，發(fā)現(xiàn)他與一起搶劫案有關(guān)，可他為什么要領(lǐng)養(yǎng)咬人龜？

柯南在和大家一起吃壽司的時(shí)候?qū)⑿∥謇陕樽恚?dāng)面戳穿了前來(lái)領(lǐng)獎(jiǎng)的兩名冒牌貨，幫胡桃找到了記憶中的少年。雖然這件事情成功解決，但是十五年前的連續(xù)殺人案卻依舊找不到眉目，案件將在三天后失效，可目前追查兇手的線索卻只有有兩條。在柯南一行人去步美家玩的時(shí)候，灰原說(shuō)自己在這棟公寓里遇見(jiàn)了一個(gè)穿著大衣吹著口哨的男人，難道十五年前的殺人兇手出現(xiàn)了？