毛利小五郎受久須美工械廠社長的委托，調查工廠零部件被偷的案件，為了不引起職員的警惕，柯南和小蘭也一同隨行假裝參觀。在對職員們暗中調查后，行為怪異的谷崎成為毛利小五郎的懷疑對象，三人計劃在倉庫抓住罪犯的現行，不料卻發現谷崎死在了反鎖的房間里。正當案件一籌莫展時，谷崎生前研究的老鼠機器人引起了柯南的注意。

毛利小五郎帶小蘭和柯南到傳說有天狗出沒的山里玩，路遇鄉土學者下村昌三。天色已晚，小五郎他們只好在民宿住上一晚。第二天，在小蘭的提議下，大家去附近的洞窟景點參觀，卻意外撞到鎮長帶著天狗的面具，在洞窟懸崖上的祠堂上吊自殺。鎮長為何要扮成天狗？他自殺的動機又是什么？

毛利小五郎帶柯南和小蘭來高級餐廳用餐，進門后三人發現桌上擺滿了食物卻沒有客人，并在廚房發現了倒在地上的廚師口石先生。清醒后的口石先生告訴三人，原本有五名客人在餐廳里用餐，不料自己在做飯時遭到了歹徒的襲擊，客人們也不知去向。毛利小五郎馬上通知了目暮警官，并查清了每個客人的身份，然而卻難以判斷消失的客人們去了何處。正在這時，擺放在餐桌上的甜點和雜物引起了柯南的注意。

米小圈的班級成功被當選為文化交流班，這意味著一群藍眼睛黃頭發的卷毛將要和米小圈所在的同學相處幾天，同學們第一次接觸外國小朋友，都是滿滿的好奇心。課間十分鐘，同學們便在操場上做才藝展示，外國友人給鐵頭他們展現了剛剛學到的中國武術拳法，鐵頭看得津津有味。該中國小朋友上場了，鐵頭給他們表演了太極拳，太極柔中有剛，出神入化，藍眼睛們也看得入了迷。這次國際交流，不僅僅讓同學們大開眼界，連肌肉老師也非常好奇，來學校的體育老師是個金發碧眼又高挑性感的女性，肌肉老師看到她在拿體育器材，立刻上前幫忙，誰知卻不小心將外籍友人的裙子給刮破了，他非常緊張，立刻將自己的外套脫下來給金頭發，但是對方毫不在意，直接將裙子順勢扯成另外的款式，原來他們在裙子里也有穿內襯，根本不打緊，金頭發將裙子的布片做成絲帶綁在頭上，肌肉老師既佩服又欣賞。按照教材大綱的要求，肌肉老師將調高的桿子放在了標準高度，但是金頭發根本沒有在乎教材的標準，直接提到最高，肌肉老師看到金頭發很颯爽地跳過去，他炫耀著一陣緊實的肌肉正要大顯身手，忽然被跳桿給絆倒了，眾目睽睽下輸給了外國友人，竟然還是個女同志，肌肉老師非常難為情，強忍眼淚跑回到辦公室。阿爾

高木警官突然來電要找柯南，他說柯南是殺人事件的知情人。畫家北園青峰下午三點半左右在家被人殺害， 警方為了確定嫌疑人之一北園先生的弟子西山大樹的不在場證明把柯南叫來，因為事發當日西山將柯南和朋友們作為模特畫了一幅風景畫。北園先生的兩位弟子和妻子都似乎與北園先生有過糾紛，這次的案件讓警察們陷入困局。