阿笠博士和少年偵探團(tuán)在河灘看螢火蟲的時(shí)候，垂水打電話給運(yùn)來螢火蟲的中嶺，不想電話的另一邊卻傳來痛苦的呻吟聲，于是大伙兒匆忙驅(qū)車趕往事發(fā)地點(diǎn)，到達(dá)時(shí)中嶺已經(jīng)在自己的車子里停止了呼吸，在他的旁邊還有一瓶有毒的飲料，有四人具有犯案嫌疑小和田道武以及他的女兒小葵、垂水和達(dá)馬，就在鳴龍梳理案情時(shí)，柯南注意到了元太從垂水車上拿的手電筒，這正是破案的關(guān)鍵！

小五郎帶柯南和小蘭去菜園屋頂?shù)臅r(shí)候，發(fā)現(xiàn)了其中一塊菜田主人中村的尸體，表面上看像是因?yàn)槟_底打滑磕到了后腦勺的意外死亡，但柯南察覺到了其中的蹊蹺，警察找來屋頂菜園的其他三名種植者進(jìn)行偵訊，每個(gè)人都沒有不在場的證明，并且其中一人的供詞卻引起了柯南的注意，當(dāng)大伙兒再次來到菜園進(jìn)行現(xiàn)場調(diào)查時(shí)，柯南發(fā)現(xiàn)了一塊奇怪的磚頭，而這無疑是找出兇手的關(guān)鍵線索。

在鈴木財(cái)團(tuán)的支持下龍馬展的保全措施做的非常好，而柯南在廁所思考之前遺失的龍馬遺物的時(shí)候基德忽然出現(xiàn)！柯南追著基德來到展館內(nèi)部的時(shí)候發(fā)現(xiàn)園子的袖子上粘到了奇怪奇怪的東西，而柯南也發(fā)現(xiàn)了基德所謂下雨的真實(shí)含義。基德按照約定來到了展館內(nèi)而樽見利用假的被盜信息來出售贗品的事實(shí)也最終曝光。

雖然警方再次對這三名嫌疑人進(jìn)行詢問，但因?yàn)槊總€(gè)人都坐在看不到我妻點(diǎn)餐內(nèi)容的位置，所以根本無法預(yù)知死者會(huì)拿哪一盤壽司，案件再遇瓶頸，這時(shí)柯南在我妻的回轉(zhuǎn)臺上看到了塑膠包裝的一角，加之博士向灰原借手帕這一細(xì)節(jié)，他突然明白了兇手的作案手法，那么兇手一定是他！于是，柯南以阿笠博士為掩護(hù)當(dāng)場指認(rèn)兇手……

小五郎帶柯南和小蘭去露天浴場泡溫泉的時(shí)候，聽到了咔嚓咔嚓的石頭滑落聲，當(dāng)他們尋聲趕到后，發(fā)現(xiàn)不動(dòng)產(chǎn)社長梅津英章已經(jīng)沒了呼吸，這起看似意外的事件其實(shí)是樁蓄意殺人案，警察對在場的嫌疑人即死者的女兒麻麗、泰子、秘書八木橋以及浴場老板進(jìn)行偵訊，期間，一條擰干的毛巾從麻麗的包包中掉了出來，小五郎認(rèn)為這是她為了不留指紋而使用手法，就在他準(zhǔn)備揭穿所謂的兇手時(shí)，知道真相的柯南將他麻醉揪出了真正的兇手！