混凝土殺人事件還未解決網上就已經鬧得沸沸揚揚，說是案件真兇是外星人而警察在故意隱瞞外星人的存在，將案件告訴過毛利小五郎的千葉警官為此被訓斥了一番。柯南可以確定的是這起案件是人為的殺人事件，在走訪犯罪嫌疑人朽木后柯南有了線索，到底朽木是用什么方法殺了被害人呢？

柯南和平次傳來歷史學家的死訊，眾人陷入恐慌，并認為是怪物鵺在作怪。平次吩咐大家各自回房不要出門，考古學家主動要求與小蘭交換房間。眾人回房后，柯南與平次在院子里和村長詢問細節，院子卻突然再次著火，與此同時樓上的考古學家似被不明物體擊中，慘叫一聲后倒在房內，待柯南等人趕到時已經喪命。經過一番調查和推理，柯南和平次似乎有些眉目，而那只被大家遺忘在家中的狗突然引起了二人的注意。

目睹柯南墜崖的眾人陷入了痛苦和無助之中，警察署的搜查工作也一籌莫展，然而小哀卻覺得此事另有蹊蹺，便獨自上路尋找柯南。另一方面伊勢原在柯南的幫助下成功脫險，二人在山中的木屋與小哀相遇。在三人的設計和警方的幫助下，抓捕佐羅的行動圓滿完成。正當眾人以為此事已畫上句點時，柯南卻發現案件仍有疑點……

米小圈的班級成功被當選為文化交流班，這意味著一群藍眼睛黃頭發的卷毛將要和米小圈所在的同學相處幾天，同學們第一次接觸外國小朋友，都是滿滿的好奇心。課間十分鐘，同學們便在操場上做才藝展示，外國友人給鐵頭他們展現了剛剛學到的中國武術拳法，鐵頭看得津津有味。該中國小朋友上場了，鐵頭給他們表演了太極拳，太極柔中有剛，出神入化，藍眼睛們也看得入了迷。這次國際交流，不僅僅讓同學們大開眼界，連肌肉老師也非常好奇，來學校的體育老師是個金發碧眼又高挑性感的女性，肌肉老師看到她在拿體育器材，立刻上前幫忙，誰知卻不小心將外籍友人的裙子給刮破了，他非常緊張，立刻將自己的外套脫下來給金頭發，但是對方毫不在意，直接將裙子順勢扯成另外的款式，原來他們在裙子里也有穿內襯，根本不打緊，金頭發將裙子的布片做成絲帶綁在頭上，肌肉老師既佩服又欣賞。按照教材大綱的要求，肌肉老師將調高的桿子放在了標準高度，但是金頭發根本沒有在乎教材的標準，直接提到最高，肌肉老師看到金頭發很颯爽地跳過去，他炫耀著一陣緊實的肌肉正要大顯身手，忽然被跳桿給絆倒了，眾目睽睽下輸給了外國友人，竟然還是個女同志，肌肉老師非常難為情，強忍眼淚跑回到辦公室。阿爾

少年偵探團的理科自由研究作業是拍攝鎮子的全景照片，為此阿笠博士帶他們來到云丸山露營，在山中小屋他們遇到了正在爭吵的四人，而三年前意外去世的元木是他們爭吵的焦點。爭吵過后岳美負氣離開睡在了懸崖底下，半夜的時候榮子等人為三年前因意外去世的元木默哀，正好醒來的柯南見證了這一幕，但在第二天元太卻發現山下的岳美小姐倒在了血泊中。