寒假的這天柯南發(fā)燒了休息，而原本約定好的在步美家的紙牌游戲也沒(méi)有辦法參加。就在和步美通電話時(shí)忽然有個(gè)叫做正南的小男孩說(shuō)有陌生人闖進(jìn)家中敲開(kāi)了步美家的門，但之后他的父母便過(guò)來(lái)把他帶走了。看似小孩子的惡作劇但柯南卻發(fā)現(xiàn)其實(shí)他們不是真的父母，正南可能真的面臨危險(xiǎn)！于是少年偵探團(tuán)的各位來(lái)到正南的家里一探究竟。

照經(jīng)營(yíng)管理出租公寓的桐谷貴江婆婆的說(shuō)法，小五郎每個(gè)禮拜都會(huì)到她家里幫忙解決難題，對(duì)此感到難以置信的小蘭和柯南一起來(lái)到了桐谷婆婆家里等待，而出現(xiàn)的卻是自稱婆婆孫女男友的恩田，而他特地打扮成小五郎的目的只是為了探望婆婆的情況。婆婆管理的出租公寓內(nèi)傳來(lái)了慘叫，作為房客的傅川先生被害，而真正的兇手就在發(fā)現(xiàn)尸體的三個(gè)房客之中。

園子中學(xué)時(shí)的好友矢內(nèi)小姐拜托小五郎幫她重新調(diào)查姐姐的自殺案件，而她也是這次事件的目擊者之一。被警方認(rèn)定為自殺案件的這起事件還存在著很多疑點(diǎn)，事發(fā)當(dāng)天正在商量明年創(chuàng)立祭的矢內(nèi)小姐和顧問(wèn)児玉老師看到了受害人在模型社里自殺的一幕，第一個(gè)趕到現(xiàn)場(chǎng)的是受害人的未婚夫柴垣老師，而柯南在還原現(xiàn)場(chǎng)時(shí)看出了端倪。

為了趕上先搭上巴士前往滑雪場(chǎng)的少年偵探團(tuán)一行人，柯南和灰原只好請(qǐng)昴先生駕車前往，途中他們巧遇高木警官，正在和高木警官談話的時(shí)候事件發(fā)生了。趕往現(xiàn)場(chǎng)后他們看到了從公寓高樓墜落的遺體，案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)附近發(fā)現(xiàn)又三人認(rèn)識(shí)墜落的男子，在搜查之后啤酒的泡沫、咖啡的熱氣和未燃完的香煙成為了三人不在場(chǎng)證明的證據(jù)。

結(jié)束大致的案件詢問(wèn)之后柯南一行人決定開(kāi)車送圭小姐回家，卻發(fā)現(xiàn)圭小姐家中被安裝大量的竊聽(tīng)器，在尋找竊聽(tīng)器的安裝地點(diǎn)時(shí)竟然找到了一具男尸。另一方面跟著打算買東西的圭小姐而離開(kāi)公寓的柯南被綁架，接到小蘭的電話后阿笠博士立即和灰原在昴先生的陪同下開(kāi)始追蹤，而了解了事情始末的世良也前去和小蘭會(huì)面。