小五郎在樓下喝咖啡時(shí)，看服務(wù)員祥子心事重重的樣子，詢(xún)問(wèn)得知，一個(gè)一直給她發(fā)MAIL的小男孩小滿(mǎn)，今天突然給她發(fā)了四封奇怪的訊息，想到小滿(mǎn)可能遇到危險(xiǎn)，大家都十分擔(dān)心，可當(dāng)務(wù)之急是確定小滿(mǎn)的位置，根據(jù)祥子提供的線索，柯南把目標(biāo)鎖定在中洗、久更津和枯前崎三個(gè)地方，但打電話過(guò)去詢(xún)問(wèn)卻并未查到他們的蹤跡，小滿(mǎn)到底出了什么事情？

警方并沒(méi)有找到柯南等人看到的當(dāng)時(shí)那名男子所穿的灰色外套和背包，就在高木和佐藤準(zhǔn)備離開(kāi)的時(shí)候，已經(jīng)知道兇手手法的柯南有意向他們做出暗示，根據(jù)柯南的提示警方破解了兇手制造不在場(chǎng)證明的手法，因此，加藤終究難逃法網(wǎng)。破案之后，高木警官?zèng)Q定在離開(kāi)之前向佐藤警官表白，可是話剛到嘴邊，目暮警官就突然出現(xiàn)并告訴他……

倫子在密室中上吊死了。群馬縣的山村警官認(rèn)為這是一起偽裝成自殺的密室殺人案而展開(kāi)了搜查，并向純，享，耀治等人詢(xún)問(wèn)情況。而三人案發(fā)時(shí)看起來(lái)也沒(méi)有什么異常。之后柯南留意到只有書(shū)架上的百科辭典沒(méi)有按卷數(shù)依次擺放的細(xì)節(jié)并找到了隱藏在書(shū)架里的密道并已毛利小五郎的省份給山村警官發(fā)送了提示短信最終將犯人抓獲。

因接到電視臺(tái)的邀請(qǐng)，小五郎便帶著柯南和小蘭飛到?jīng)_繩，參加一個(gè)與職棒選手能勢(shì)和主持人本山對(duì)談的節(jié)目錄制。在機(jī)場(chǎng)與本山會(huì)合之后，一行人打算去能勢(shì)下榻的酒店接他，沒(méi)想到卻在半路發(fā)現(xiàn)了能勢(shì)的尸體，期間，本山的一句話讓柯南認(rèn)定他就是兇手，可能勢(shì)死亡的時(shí)候，他正在飛機(jī)上，因此有充分的不在場(chǎng)證明，那么，他到底是如何往返于兩個(gè)地方犯案的？

警方在繩子和藥瓶上發(fā)現(xiàn)的指紋居然不是屋子里任何一個(gè)人的，那么就排除了他們犯案的可能，再休息之前柯南建議警察再次對(duì)他們每個(gè)人的怪癖進(jìn)行調(diào)查確認(rèn)，然而，卻并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)有何異常，案件一度遭遇瓶頸，到底是忽略了哪里的線索？這時(shí)，小蘭無(wú)意中的一句話提醒了柯南，原來(lái)犯案的不止一人。