阿笠博士帶柯南他們一起去吃回轉(zhuǎn)壽司的時(shí)候，遇見(jiàn)了一個(gè)讓人反感的客人我妻，他不僅挖苦元太和周遭的客人，而且還與這里的店長(zhǎng)發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)，當(dāng)柯南他們準(zhǔn)備離開(kāi)這種不愉快的氛圍時(shí)，我妻突然十分痛苦的倒地不起，柯南立刻判斷出他是被人毒殺，有三個(gè)曾與死者有過(guò)節(jié)的人成為了首要懷疑對(duì)象，然而警察并未從他們身上到隱藏的毒藥，兇手到底是誰(shuí)？他又是如何讓我妻拿到沾有毒藥的盤(pán)子？

這個(gè)安置炸彈引起恐慌的不是別人，正是扮演無(wú)辜公民的綁著炸彈的那個(gè)男人，柯南不僅揭穿了他的身份還將他曾經(jīng)殺人的事情公之于眾，案件圓滿(mǎn)解決之后，柯南看到了不不明人士傳給小五郎的推理簡(jiǎn)訊，根據(jù)目擊者所說(shuō)傳簡(jiǎn)訊的那人很可能就是面帶傷疤的赤井秀一，待柯南追出去的時(shí)候發(fā)現(xiàn)赤井已經(jīng)離開(kāi)了大廈，而蓄意暗殺他的黑衣組織也因接到幕后老板的指示撤消了暗殺行動(dòng)。

柯南、小蘭和小五郎在百貨公司吃飯的時(shí)候，結(jié)識(shí)了樂(lè)隊(duì)吉他手中村悠介，之后，小蘭和他一起去地下室拿取CD，沒(méi)想到竟然在休息室看到了主唱渡邊友紀(jì)子的尸體，警方立刻展開(kāi)調(diào)查并且對(duì)樂(lè)隊(duì)其他人進(jìn)行偵訊，每個(gè)人都有殺人的動(dòng)機(jī)和嫌疑，就在他們互相指責(zé)懷疑之時(shí)，柯南在八樓發(fā)現(xiàn)了關(guān)鍵性的線(xiàn)索，兇手果然就是那個(gè)人！

這天作為地區(qū)體驗(yàn)采訪(fǎng)的嘉賓，小蘭和柯南來(lái)到了岡山。在參觀美術(shù)館的時(shí)候遇到失去記憶的奇怪女人，而在經(jīng)過(guò)檢查后發(fā)現(xiàn)身上還有扭打的痕跡。而趕來(lái)小五郎接受了調(diào)查她過(guò)去的委托。通過(guò)她畫(huà)的畫(huà)小蘭她們開(kāi)始尋找她的記憶，而就在這時(shí)柯南發(fā)現(xiàn)她們被跟蹤了。在來(lái)到野崎家的大宅之時(shí)出現(xiàn)了認(rèn)識(shí)她的人而她的名字是吉瀨萬(wàn)由美，找回名字的萬(wàn)由美卻突然逃走了！

來(lái)到倫敦的柯南不小心以新一的身份向小蘭暴露在倫敦的事實(shí)，而此時(shí)柯南喝下了回國(guó)用的解毒劑暫時(shí)以新一的身份出現(xiàn)！在繼續(xù)調(diào)查的過(guò)程中小蘭從以前新一說(shuō)過(guò)的話(huà)中得到啟發(fā)發(fā)現(xiàn)了人偶的秘密。而之后通過(guò)與新一電話(huà)中發(fā)現(xiàn)了更多的線(xiàn)索。這時(shí)小蘭和小五郎碰到了米奈芭小姐，在米奈芭和弟弟阿波羅的協(xié)助下小蘭留在教堂的紙片，而上面寫(xiě)著的就是接下來(lái)的線(xiàn)索。