京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來勢突然朝廷內外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱知道香氣由來，原來紀曉嵐為了撰寫《四庫全書》而廣征天下藏書，好友顏驥踴躍獻書。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動下，將顏驥全家賜死。紀曉嵐無力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認為一切都因紀曉嵐而起，決定替父報仇，紀曉嵐扮作戲子，在戲臺之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

和珅讓徐有慶根據從乾隆那里抄來的要點擬題，徐有慶表示為了錦繡前程，愿意為和珅效勞。和琳提醒和珅要提防徐有慶，和珅不以為然。紀曉嵐對徐有慶的判若兩人感到不解，決定一探究竟。趙新進由于幫助紀曉嵐調查舞弊之事，遭到奸人陷害而變瘋。趙青表示要替哥哥參加會試。她認為哥哥的名字出現在榜首時，他的病情就會好轉。紀曉嵐苦口婆心地告誡趙青替考也是舞弊露，趙青不為所動，并再度不辭而別。徐有慶告訴紀曉嵐自己在施苦肉計，只為了得到更多和珅的舞弊證據。和珅與和琳從徐有慶的話語中發現了破綻，決定將其滅口，以防后患。紀曉嵐暗示乾隆試題被泄露。王喜知道難逃一死，便服毒自盡，臨死前誣陷紀曉嵐為幕后主使。紀曉嵐意識到徐有慶要遭不測，貼告示尋找徐有慶。臨考前，和珅貌似悠閑地購買了一大批鴿子。鑒于上一次的經驗教訓，乾隆將此次會試的搜撿設置得更加嚴格。

假戲真作，不如不作。既是三百里流放，皇上和兩個伴駕的臣子紀曉嵐、和便分別都有了一個綽號：金三爺、紀老大與和二。幾個人不問尊卑、素服簡出，為向哪個方向去，只好抓鬮決定，紀曉嵐作過手腳，眾人自然直奔曲陽。 “金三爺”不勝徒步奔波之勞苦，又饑又渴。“紀老大”卻頗會苦中求樂，最可憐的當屬“和二”，要忠心耿耿地伺候皇上，還得時不時領受紀曉嵐的挖苦。一路同行，笑話多多。終于在這夜半三更才投宿一家東升客棧。他們前腳剛至，小月與洪霞后腳便至。 直隸總督尚榮委派手下一一打點，皇上可能路經住宿的客棧。“金三爺”等三人一來，即被店家及尚榮的差役發現，不敢怠慢。連給他們各個所做的飯菜亦有等級差別。

眾閱卷官宴請紀曉嵐，暗地給紀曉嵐的湯里下藥。趙文龍假裝與和珅有秘事商談，小月中計，跟隨兩人到澡堂。和珅故意斥責紀曉嵐沉迷女色，與趙青關系暖昧。紀曉嵐藥性發作，昏睡過去。左山傀帶領眾閱卷官將原始考卷搬走，并造成紀曉嵐抽煙失火的假象。小月越聽越氣，趕回貢院要跟紀曉嵐問個究竟，卻發現紀曉嵐房里失火，于是奮不顧身將其救出。為了找尋徇私舞弊的證據，紀曉嵐帶乾隆前往香積庵。主持了凡正要殺趙青滅口，聞聽紀曉嵐到來，匆忙外出迎接。乾隆以布施為由要參觀香積庵，紀曉嵐提出要察看地牢。了凡有意勾引乾隆。

軍豪不愿見到朝中大亂，黎民涂炭的悲劇出現，冒死諫阻。忠言逆耳、皇上大怒。莫愁以家國為名，表示愿放棄兒女之情，并險些喝下墮胎之藥。幸虧紀曉嵐以三寸不爛之舌，說服她靜待時日，總有一天可以破鏡重圓。皇上寧為玉碎，不愿瓦全，斷然拒絕墮胎入宮的提議，要帶莫愁奔走天涯。和與紀曉嵐難得默契合作，強行挽留住了他的腳步。 中秋佳節，皓月當空，卷帙浩樊的《四庫全書》編纂工作大功告成，皇上應邀來閱微草堂，與兩情相悅的莫愁團圓依偎在一起。和、太后先后亦登臨紀府，異口同聲要求皇上回宮。正鬧得人仰馬翻之際，莫愁突然動產，生死攸關，太后以過來人的經驗竟擔當起接生婆的工作。 小皇子呱呱落地，眾從如釋重負。等著嗷嗷待哺的孩子，太后身上的母性復蘇，破天荒地承認了這是皇家血脈，一樁延宕多日，屢經曲折的姻緣終于名正言順，成為事實。 皇恩浩蕩，軍豪恢復狀元名號與小月重修百年之好，豐紳殷德亦接受賜婚，與十八格格結為夫妻。勞苦功高的紀曉嵐，則被賜賞了一桿金煙袋，作為“尚方寶劍”。從此，天下的貪官污吏任紀曉嵐敲打，天下的不平之事由紀曉嵐主持公道……"