小五郎一大早便被少年偵探團(tuán)纏上，他們委托小五郎調(diào)查的案件是米花町活動(dòng)中心的花圃破壞事件，而在調(diào)查過(guò)程中與山崎小姐發(fā)生爭(zhēng)執(zhí)的花店老板奧田態(tài)度非常惡劣，因?yàn)樾D小姐的緣故小五郎決定介入調(diào)查。當(dāng)眾人晚上再次來(lái)到活動(dòng)中心時(shí)花圃已經(jīng)遭到了破壞，在破壞的花圃旁還看見(jiàn)了山崎小姐的尸體，奧田被當(dāng)場(chǎng)抓住，但事件的真相到底是什么呢？

和笹本小姐一起晨跑的高木警官在路上撿到了一個(gè)皮包，打開(kāi)之后里面竟是3千萬(wàn)的巨額鈔票，沒(méi)過(guò)多久鈔票的失主平沼先生便來(lái)到了警局。經(jīng)過(guò)調(diào)查之后高木警官發(fā)現(xiàn)平沼先生丟錢(qián)的時(shí)間有所出入，仔細(xì)觀(guān)察后的柯南得出了結(jié)論，平沼先生是在早上故意將錢(qián)放在路上，而他想把錢(qián)交給的則是有著晨跑習(xí)慣的笹本小姐，但他的用意卻讓眾人很困惑。

毛利一家和柯南想要去的餐館正在施工，很多以前的建筑都被重建或者改造，正當(dāng)毛利感嘆的時(shí)候工地里傳來(lái)了很大的聲音。建筑器材的散落發(fā)生了命案，被壓在鋼管底下的是朱古先生，而捆綁鋼材的帶子上有被割過(guò)的痕跡。最有可能作案的便是在場(chǎng)的三人，而這三個(gè)人都有作案動(dòng)機(jī)，在檢查了命案現(xiàn)場(chǎng)后柯南有了線(xiàn)索。

這起靈異殺人事件所用到的手法柯南和平次基本都清楚了，在他們?yōu)榇蠹医沂玖诉@些看似詭異的手法后又發(fā)生了命案，這次被害的是消失已久的長(zhǎng)女。案件又陷入了謎團(tuán)，擔(dān)心被害的人們都躲在自己的房間里，而女仆小光的一個(gè)提示讓柯南和平次找到了新的線(xiàn)索，但他們現(xiàn)在還缺少?zèng)Q定性證據(jù)。

為了趕上先搭上巴士前往滑雪場(chǎng)的少年偵探團(tuán)一行人，柯南和灰原只好請(qǐng)昴先生駕車(chē)前往，途中他們巧遇高木警官，正在和高木警官談話(huà)的時(shí)候事件發(fā)生了。趕往現(xiàn)場(chǎng)后他們看到了從公寓高樓墜落的遺體，案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)附近發(fā)現(xiàn)又三人認(rèn)識(shí)墜落的男子，在搜查之后啤酒的泡沫、咖啡的熱氣和未燃完的香煙成為了三人不在場(chǎng)證明的證據(jù)。