小蘭、園子和世良三人在上學(xué)途中發(fā)現(xiàn)了路旁的遺體，遺體的旁邊留下了用血寫下的“死”字，這就和十年前工藤優(yōu)作唯一沒有揭穿犯人的事件幾乎一樣，為了調(diào)查這兩期案件的共同點(diǎn)，他們打電話給高木警官，但參與十年前案件的目暮警官看過遺體后卻以竊盜事件定性，回憶著十年前的一幕幕柯南依舊沒有明白自己父親的用意。

毛利偵探事務(wù)所突然出現(xiàn)了一個(gè)帶著手槍和炸彈的男子，他將小五郎、小蘭和在之前案件中結(jié)識(shí)的小蘭的新同學(xué)世良真純都挾持成人質(zhì)。這個(gè)名為沢栗熏的男子是一個(gè)月前在溫泉旅館自殺的推理小說家沢栗未紅的哥哥，他因?yàn)椴幌嘈琶妹玫乃朗亲詺ⅲ虼饲皝硪蟪了男∥謇商嫠忾_案件背后的真相，而他所帶來的三位女士也正是他懷疑的對(duì)象，他揚(yáng)言找到真兇后自己將會(huì)與對(duì)方同歸于盡，面對(duì)如此棘手的案件，柯南該如何解決平安救人質(zhì)？

泡沫、熱氣和煙的實(shí)驗(yàn)與室溫并沒有關(guān)系，在聽到三人單獨(dú)的問話后柯南鎖定了兇手。再次來到公寓的柯南又實(shí)施了實(shí)驗(yàn)，事發(fā)時(shí)吵鬧不停的鬧鐘和他們到達(dá)案發(fā)現(xiàn)場(chǎng)的時(shí)間成為了案件的突破口，而柯南也明白了制造出不在場(chǎng)證明假象的手法，案件的真相終于揭曉，而在真相的背后又隱藏著不為人知的悲劇。

看起來像是連續(xù)殺人的案件卻被定性為盜竊事件，世良等人對(duì)警視廳產(chǎn)生了懷疑，而昴先生也在她們的談話中知道了他現(xiàn)在所住房子的主人便是工藤新一。在園子和世良的慫恿下小蘭打通了新一的電話，感到不妙的柯南急忙躲進(jìn)廁所里，當(dāng)小蘭提到昴先生給新一的留言后柯南恍然大悟，這次案件的真相即將揭曉但柯南的秘密卻被昴先生發(fā)現(xiàn)。

撿到地圖上的四個(gè)記號(hào)讓光彥等人認(rèn)為將會(huì)有案件發(fā)生，少年偵探團(tuán)再次出動(dòng)逐戶去敲門提醒，而這四戶中的香月先生卻意外身亡。調(diào)查回來的柯南遇到了發(fā)現(xiàn)香月先生的小狗酷兒，趁光彥等人不注意而被偷走的地圖正是酷兒的主人八木澤先生為了遛狗理由而畫下的，偷走這樣地圖的無疑就是這次事故的兇手，而關(guān)鍵詞則是香煙。