元太在奧米花的路口邊找東西時(shí)，突然被身后狂奔而來的紅衣男子撞倒，元太追逐紅衣男子未果，便叫來少年偵探團(tuán)一起幫他尋找紅衣男子的下落。正當(dāng)幾人爭論不休時(shí)，柯南等人被警察叫住詢問，這才得知該紅衣男子竟是一名搶劫犯，于是少年偵探團(tuán)便決定幫助警察抓到紅衣男子。與此同時(shí)，另一名紅衣男子來到警察局，告訴警察他失憶了，卻被警察以嫌疑人的身份進(jìn)行追捕。這名紅衣男子究竟是不是搶劫犯？感覺此事另有蹊蹺的柯南展開了調(diào)查。

柯南等人來到方斗寺調(diào)查會(huì)預(yù)知未來的佛像一事，因天色已晚便決定在寺院內(nèi)留宿。正當(dāng)眾人享用晚飯時(shí)，突然從房內(nèi)傳出一聲慘叫，原來是正在房中念經(jīng)的住持被人殺害。毛利小五郎通過柯南在院內(nèi)找到的一些線索，推斷出了兇手的身份，然而正當(dāng)兇手跪地坦白自己的罪行時(shí)，柯南突然發(fā)現(xiàn)案件并沒有結(jié)束……

柯南所在的班里來了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫線，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉庫里可能有石灰，元太和光彥開玩笑說舊倉庫有幽靈出沒，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉庫。在尋找石灰的過程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門，眾人合力打開門后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……

小五郎受J聯(lián)賽之邀擔(dān)任東京SPIRITS隊(duì)和大阪鋼巴隊(duì)的比賽開球儀式嘉賓，柯南與小哀他們也跟著小五郎來參觀后臺(tái)。步美是東京SPIRITS隊(duì)11號(hào)赤木英雄球員的粉絲，這次是英雄受傷后的首次出賽，步美本想送自制飲料給英雄，但因規(guī)定只能將賽場提供的運(yùn)動(dòng)飲料遞給了英雄。小五郎見狀也要了一瓶飲料解渴，但卻沒想到因此引發(fā)了不良反應(yīng)。

平次參加了全國高中生劍道大賽，他在個(gè)人賽中獲得了優(yōu)異的成績，他決心打敗對手沖田然后向和葉告白。但是事情進(jìn)展的并不順利，中場休息時(shí)場外發(fā)生了一起兇殺案。裁判拔谷士道在室外廁所旁被殺害，兇手穿著京都泉心高中的劍道護(hù)具，現(xiàn)場沒有目擊者，只有一位雙目失明的老人聽到了聲響。