柯南等人通過(guò)電訊公司查到了三個(gè)可疑人士，之后，他們又分別向當(dāng)時(shí)不明人打電話的出處進(jìn)行確認(rèn)，最終將目標(biāo)鎖定在一家以推理家命名的店，店主說(shuō)當(dāng)時(shí)打電話的是一個(gè)帶著墨鏡常來(lái)光顧的客人，于是，柯南等人迅速趕往此處，正巧遇到了這名客人，就在小五郎要上前詢問(wèn)時(shí)，柯南將他麻醉，把事情的來(lái)龍去脈說(shuō)的一清二楚，并利用小孩子的身份，從墨鏡男口中騙取了這個(gè)手機(jī)的號(hào)碼，警方順藤摸瓜，找到了手機(jī)主人的住處，還發(fā)現(xiàn)了有關(guān)賄賂的賬簿。

就在警方和小五郎集中精力思考兇手是如何調(diào)換毛巾時(shí)，柯南卻重返飯桌，回憶當(dāng)時(shí)自己為拿醬油和辣油轉(zhuǎn)旋轉(zhuǎn)桌面時(shí)的場(chǎng)景，這時(shí)他突然想到或許兇手根本就不是用有毒毛巾殺人的可能，在向鑒識(shí)人員確認(rèn)了自己的想法后，兇手浮出水面，他讓所有人都按照案發(fā)時(shí)的位置做好，并重現(xiàn)當(dāng)時(shí)的場(chǎng)景，而兇手卻在不知不覺(jué)間自己露出了馬腳。

柯南和阿笠博士從板倉(cāng)的日記磁片中果然找到了他與黑暗組織接觸過(guò)的線索，這讓柯南興奮不已，于是兩人立馬趕往板倉(cāng)的別墅，企圖找到板倉(cāng)所開(kāi)發(fā)的系統(tǒng)軟體和黑衣組織發(fā)來(lái)的郵件，然而，讓他們沒(méi)想到的是，郵件竟然有密碼，如果在一定時(shí)間內(nèi)沒(méi)有打開(kāi)，郵件將自動(dòng)刪除，而這將引起黑衣組織的懷疑，這時(shí)，屋內(nèi)的電話響起，從另一邊傳來(lái)沃克質(zhì)疑的聲音，柯南和阿笠博士該如何應(yīng)對(duì)？

阿笠博士帶著柯南和哀拜訪了哀父親的兒時(shí)的玩伴出島。但就在這時(shí)出島卻被毒死！小哀擔(dān)心可能是暗黑組織發(fā)現(xiàn)了姐姐留下的東西而殺人滅口，但柯南予以否定并道出了兇手利用廁所的抽紙而實(shí)行的殺人計(jì)劃，而兇手正是設(shè)計(jì)所的設(shè)計(jì)員。案件解決后小哀終于拿到了姐姐留下的媽媽的遺物。另一方面黑衣人一伙似乎也有了新的行動(dòng)。

帶著小蘭抽到的一張餐飲招待券，柯南一行人來(lái)到中華街的一家餐廳，并在那里與剛結(jié)識(shí)的幾名電影相關(guān)人士同一桌吃飯，只是沒(méi)有想到坐在柯南旁邊的川端突然毒發(fā)身亡，之后，警方介入調(diào)查但并未從川端的衣物上檢查出毒物反應(yīng)，反而從他使用的盤(pán)子和毛巾上測(cè)出毒物，警官便因此懷疑坐在死者身邊的小五郎。而另一邊，身體不適的小蘭也不知所為何事而心事重重。