小月望著一片廢墟、傷心之極。從小春口中得知紀(jì)曉嵐等已從暗道逃走，小月破涕為笑。乾隆向百官念叨缺少銀兩以備軍需，紀(jì)曉嵐帶領(lǐng)著工匠出現(xiàn)，許諾可以幫乾隆解決難題。人證、物證俱在，齊蘇圖只得低頭認(rèn)罪。銀妃以死要挾乾隆放過(guò)齊家。見(jiàn)乾隆不為所動(dòng)，銀妃自盡。和珅為了擴(kuò)大自己在朝中的勢(shì)力，暗中支持村夫李二組織邪教，從而謠言惑眾，籠絡(luò)人心。一時(shí)之間，朝廷內(nèi)外盡是李二的信徒。工部因大做法事導(dǎo)致衙門(mén)失火。和珅答應(yīng)撥款給工部金尚書(shū)以重修工部衙門(mén)。御史海升之妻組氏參加了當(dāng)日作法，海升將失火原因告知了紀(jì)曉嵐。和珅同黨吳省蘭將作法用書(shū)《佛法心經(jīng)》奉與皇上，并夸口只要通讀此書(shū)，便可百病不侵。和珅不失時(shí)機(jī)地推薦吳省蘭任左都御史。乾隆以紀(jì)曉嵐著成《四庫(kù)全書(shū)》為由，指派他上任左都御史，并對(duì)其寄予厚望。紀(jì)曉嵐上任之時(shí)，和珅的黨羽劉構(gòu)傲慢無(wú)禮地當(dāng)眾打坐，向紀(jì)曉嵐挑釁。紀(jì)曉嵐覺(jué)察出邪教實(shí)力強(qiáng)大，決定剝繭抽絲，調(diào)查到底。

京城里彌漫著一種神秘香氣，由于來(lái)勢(shì)突然朝廷內(nèi)外俱驚。乾隆命和珅迅速查明香氣源頭。一神秘女人，自稱(chēng)知道香氣由來(lái)，原來(lái)紀(jì)曉嵐為了撰寫(xiě)《四庫(kù)全書(shū)》而廣征天下藏書(shū)，好友顏驥踴躍獻(xiàn)書(shū)。和珅卻大興文字獄。乾隆在和珅的煽動(dòng)下，將顏驥全家賜死。紀(jì)曉嵐無(wú)力回天，只有將顏驥生前收藏的西域煙草點(diǎn)燃，以此明志要為顏驥討回公道，也正是此獨(dú)特香氣使全城大亂。昔日神秘女子正是顏驥流落在民間的私生女顏如五。如玉認(rèn)為一切都因紀(jì)曉嵐而起，決定替父報(bào)仇，紀(jì)曉嵐扮作戲子，在戲臺(tái)之上拿出乾隆賜予的金煙桿，表明要為顏驥翻案的決心。

紀(jì)曉嵐夜讀時(shí)又接到被扔進(jìn)窗子的紙條，上面寫(xiě)有郭天的消息，紀(jì)曉嵐懷疑黑衣人正是張了了。紀(jì)曉嵐夜探郭天，得到通報(bào)的和珅與盧焯眼見(jiàn)沒(méi)有退路，只得慌忙扮成囚犯躺在隔壁囚房。乾隆看到瑤琴乘坐的馬車(chē)很是欣喜，不料落入盧安的圈套，也被一同押走。乾隆三人被關(guān)在洞中，外面重兵把守。乾隆佯裝自殺以騙過(guò)盧安，再見(jiàn)機(jī)救出瑤琴。紀(jì)曉嵐終于醒悟，誓要擺脫情感糾葛，全力調(diào)查國(guó)庫(kù)虧空一案。紀(jì)曉嵐扮作江湖郎中，偶遇掌管賬本的宋司庫(kù)，以自己掌握的情況博得宋司庫(kù)信任，并抓住其惶恐的心理，以消災(zāi)為由取得真賬本。和珅模不透紀(jì)曉嵐葫蘆里賣(mài)的是什么藥，便決定先下手為強(qiáng)，命盧安將瑤琴押回杭州以要挾郭天認(rèn)罪，卻沒(méi)料到乾隆在盧安即將動(dòng)身時(shí)救出瑤琴。

張了了如花似月的容貌和凄慘的經(jīng)歷博得了紀(jì)曉嵐的愛(ài)憐，還向小月借錢(qián)要替張了了贖身，被小月莫落一番。和珅看到愁眉不展的紀(jì)曉嵐，不禁幸災(zāi)樂(lè)禍。紀(jì)曉嵐在朝上似有難言之隱，乾隆讓百官退下，紀(jì)曉嵐以小月的名義將小月送給自己的鞋墊送給乾隆。紀(jì)曉嵐用和珅的銀票贖出張了了并將其帶回家，紀(jì)曉嵐對(duì)張了了的憐香惜玉讓小月很是妒忌。小月偶遇微服的乾隆，便將紀(jì)曉嵐與張了了的事告知乾隆，被路過(guò)的和珅看見(jiàn)，和珅不明所以，決定找紀(jì)曉嵐探探虛實(shí)。乾隆在朝上提出要派人南巡，和珅主動(dòng)請(qǐng)纓，乾隆對(duì)紀(jì)曉嵐旁敲側(cè)擊，想讓其同去，紀(jì)曉嵐卻以家事為由推辭。

張了了在和珅的指示下夜訪紀(jì)曉嵐，和珅與盧焯藏在暗處欲以紀(jì)曉嵐瀆職沉迷酒色為名羞辱紀(jì)曉嵐。張了了故意撞倒?fàn)T臺(tái)，引起大火，兩個(gè)早已躲在床下的家丁爬出來(lái)，紀(jì)曉嵐有所覺(jué)悟。原打算抓紀(jì)曉嵐把柄的和珅、盧焯假裝跑來(lái)救火，受到紀(jì)曉嵐的奚落。小月和杏兒設(shè)套逮住了馮青，并讓其帶路去救瑤琴。紀(jì)曉嵐借機(jī)裝病，并以小月失蹤為由拖延啟程時(shí)間，和珅與盧焯焦急萬(wàn)分。神秘黑衣人再次出現(xiàn)給紀(jì)曉嵐送信，紀(jì)曉嵐連忙追趕，卻碰上張了了，紀(jì)曉嵐開(kāi)始對(duì)張了了的身份有所懷疑。張了了受和珅指使向紀(jì)曉嵐探聽(tīng)小月行蹤，張了了暗示有人偷聽(tīng)，紀(jì)曉嵐將計(jì)就計(jì)，假裝酒后吐真言，道出小月南下救人。