就在萬由美好不容易找到自己的身份的時(shí)候卻突然逃走了，而她遺失的紙條上寫著“要知道真相就一個(gè)人來”的信息！而就在柯南追過來之后發(fā)現(xiàn)險(xiǎn)遭毒手的萬由美。在眾人調(diào)查神社時(shí)得知萬由美之前曾來過這里。晚上萬由美又再次的險(xiǎn)遭綁架，但凡人卻留下了一份借條，借此柯南推斷出了犯人的身份，而所謂的好友的身份也最終暴露出來。

為了讓扭傷腳的柯南療養(yǎng)腳傷，大伙兒一起來到城崎溫泉，然而，小蘭卻突然失蹤，柯南從光彥他們所拍的照片上看到小蘭和一個(gè)小女孩在一起，同時(shí)照片上還出現(xiàn)了一個(gè)行蹤可疑的男人。這時(shí)，柯南他們遇到了服部，他受人委托前來找一個(gè)叫陽(yáng)菜的女孩，而她正是和小蘭在一起的那個(gè)孩子。據(jù)陽(yáng)菜的父親周平所說，在陽(yáng)菜失蹤的同時(shí)他美術(shù)館里的展品彩虹之子也不翼而飛。就在大家四處進(jìn)行尋找時(shí)，陽(yáng)菜和小蘭遇到了危險(xiǎn)。

就在步美、元太他們因?yàn)槊魈炜床坏狡诖那騿T上場(chǎng)而唉聲嘆氣時(shí)，結(jié)識(shí)了一個(gè)名叫代田恭三的男人，他將對(duì)明天無限憧憬的正能量傳達(dá)給了少年偵探團(tuán)，大家也因此變的積極起來，但柯南卻察覺到這個(gè)人的異常，果不其然這個(gè)看似充滿希望的人卻企圖臥軌自殺，這到底是為了什么？小蘭誤接了“紅色長(zhǎng)袖t恤之謎”的委托，于是，柯南和小五郎一起去百貨公司會(huì)見委托人，不想?yún)s在這里遇到……

為了陪光彥把壓歲錢存進(jìn)賬戶，柯南、步美和灰原等人一起來到帝都銀行，可元太因?yàn)槌蕴辔竿戳似饋恚驮诓┦亢突以獬鲑I藥期間，一波帶著面具的搶匪突然闖進(jìn)銀行，前來取錢的茱蒂老師以及一名貌似赤井秀一的人也成為了他們的人質(zhì)，雖然茱蒂用美人計(jì)在廁所獨(dú)立擊倒一名搶匪，卻不幸被同伙發(fā)現(xiàn)，事已至此，少年偵探團(tuán)成為了將徒制服的唯一希望！

服部這次帶來的案件是五年前去世的犬伏集團(tuán)會(huì)長(zhǎng)的養(yǎng)子女們接二連三離奇死亡的事件，而且據(jù)說案件是由身上纏繞火焰像犬一樣的魔物所造成的，因?yàn)槠渲幸幻B(yǎng)子跟和葉的母親是舊識(shí)，于是柯南和服部一起登門拜訪探聽詳細(xì)情況，沒想到對(duì)方的名字竟然是工藤伸一與工藤新一讀音相似，在他們?cè)儐栔埃煲痪谷槐蝗嗽O(shè)計(jì)成一氧化碳中毒而亡，之后，前來調(diào)查的警方從死者口中發(fā)現(xiàn)了一顆掉落的珍珠，這會(huì)是死者留下的死亡訊息嗎？