柯南所在的班里來了一位新老師名叫若狹留美，若狹老師想在體育課前用石灰畫線，卻發(fā)現(xiàn)石灰已經(jīng)用完了。柯南告訴若狹老師舊倉庫里可能有石灰，元太和光彥開玩笑說舊倉庫有幽靈出沒，若狹老師感到很害怕，便拜托少年偵探團(tuán)一同前往舊倉庫。在尋找石灰的過程中，柯南發(fā)現(xiàn)一扇通往地下的門，眾人合力打開門后，卻驚人地發(fā)現(xiàn)了一具骸骨……

平次陪同和葉一起來到東京，準(zhǔn)備約小蘭與柯南一起去看彩燈。由于和葉要幫助小蘭一起做飯，平次和柯南便去樓下的白羅咖啡館打發(fā)時(shí)間。二人來到咖啡店閑聊，隔壁桌是四位來咖啡館慶生的大學(xué)生。為了一起觀看慶生視頻，其中一名男學(xué)生掏出了筆記本電腦，不料卻在插上電的一瞬間導(dǎo)致總閘跳閘，咖啡店內(nèi)瞬間一片漆黑，并有人發(fā)出一聲慘叫。當(dāng)?shù)陠T急忙重新打開總閘時(shí)，眾人卻發(fā)現(xiàn)該名男學(xué)生倒在了血泊之中……

17年前日本將棋四冠王羽田浩司遇襲案讓柯南非常在意，和他同日遇害的還有同一酒店的美國資本家阿曼達(dá)，柯南和灰原推測這是組織所為，但羽田浩司遇害時(shí)的房間卻不像是組織的一貫風(fēng)格。地產(chǎn)公司社長被害時(shí)手里拿著阿笠博士發(fā)明的剪刀，目暮警官請阿笠博士來說明剪刀的用途看是否能為破案提供幫助，柯南注意到這次的案件卻與17年前羽田浩司遇害案非常相似。

走在櫻花盛開的小道上小蘭不由得想起了與新一的初次相遇，那還是在上幼稚園的時(shí)候。急忙趕去上班的小五郎不小心踩壞了小蘭的櫻花名牌，英理只能先給女兒用紙做了一塊名牌應(yīng)急，但小蘭卻因?yàn)檫@塊名牌受到其他小朋友的譏諷，同樣是櫻花班的新一稱自己也丟了名牌，他要求小蘭也為自己做一個(gè)。

元太在奧米花的路口邊找東西時(shí)，突然被身后狂奔而來的紅衣男子撞倒，元太追逐紅衣男子未果，便叫來少年偵探團(tuán)一起幫他尋找紅衣男子的下落。正當(dāng)幾人爭論不休時(shí)，柯南等人被警察叫住詢問，這才得知該紅衣男子竟是一名搶劫犯，于是少年偵探團(tuán)便決定幫助警察抓到紅衣男子。與此同時(shí)，另一名紅衣男子來到警察局，告訴警察他失憶了，卻被警察以嫌疑人的身份進(jìn)行追捕。這名紅衣男子究竟是不是搶劫犯？感覺此事另有蹊蹺的柯南展開了調(diào)查。