柯南與少年偵探團(tuán)與阿笠博士去看足球比賽。在歸途中，遇見(jiàn)在看電視轉(zhuǎn)播其他比賽的赤野，他毒罵比賽中轉(zhuǎn)會(huì)而遭觀眾噓聲的選手。赤野是上了看球黑名單惡名昭著的狂熱不良分子。然而這個(gè)赤野在支持者混雜的電車內(nèi)被殺害了。在柯南等各位少年偵探團(tuán)的幫助下警察很快排查出了主要的嫌疑人。而就在此時(shí)灰原卻默默的走離人群？

柯南等人在警視廳鑒證連續(xù)發(fā)火現(xiàn)場(chǎng)遺留的紅馬現(xiàn)場(chǎng)照片，發(fā)現(xiàn)其中1張紅馬上有“兔”字，由此推出“紅馬”是三國(guó)志中出現(xiàn)的赤兔馬。另一方面，古董品店長(zhǎng)玄田隆德到訪諸角宅，由于他打算送給諸角亮子的塑像是騎乘著赤兔馬的關(guān)羽，玄田的名字引起了搜查線上的注意。在一系列的推理調(diào)查之后玄田被捕了，但柯南和平次卻發(fā)覺(jué)了這其中的異樣。最終在柯南和平次的聯(lián)手調(diào)查下犯人的真面目慢慢浮出水面。

被誤認(rèn)為同學(xué)片岡純而遭到綁架的柯南成功的從廢棄建筑的地下室逃脫回來(lái)。在不斷的觀看錄像帶之后高木警官發(fā)現(xiàn)了車輛忽然消失的手法。很快綁架犯吉澤正發(fā)現(xiàn)被絞死在停在停車場(chǎng)的輕型四輪車中，在搜尋同伙的時(shí)候江崎幸子成為了重要嫌疑人。而在柯南的推理下真正的綁架同伙浮出水面。在佐藤和高木警官的協(xié)助下犯人終于被捕。

柯南他們與正在公園找尋東西的高木刑事相遇。原來(lái)他在這里調(diào)解吵架后，不小心把遺失了警察手冊(cè)。高木刑事調(diào)解的當(dāng)事人之一是無(wú)名的歌手半崎，好象就住在公園附近。柯南他們分頭找尋半崎，卻不見(jiàn)他人影。正要放棄時(shí)半崎在公園里出現(xiàn)。柯南眾人發(fā)現(xiàn)半崎的疑點(diǎn)，在偵查推理之后眾人救下了顯遭殺害的杉山。高木也找回了自己的警察手冊(cè)。

柯南和阿笠博士從板倉(cāng)的日記磁片中果然找到了他與黑暗組織接觸過(guò)的線索，這讓柯南興奮不已，于是兩人立馬趕往板倉(cāng)的別墅，企圖找到板倉(cāng)所開(kāi)發(fā)的系統(tǒng)軟體和黑衣組織發(fā)來(lái)的郵件，然而，讓他們沒(méi)想到的是，郵件竟然有密碼，如果在一定時(shí)間內(nèi)沒(méi)有打開(kāi)，郵件將自動(dòng)刪除，而這將引起黑衣組織的懷疑，這時(shí)，屋內(nèi)的電話響起，從另一邊傳來(lái)沃克質(zhì)疑的聲音，柯南和阿笠博士該如何應(yīng)對(duì)？